33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0238 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0238  hypothetical protein  100 
 
 		 947 aa  1917    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2374  hypothetical protein  38.31 
 
 		 881 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0423348  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2243  hypothetical protein  38.82 
 
 		 875 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0333  hypothetical protein  39.76 
 
 		 880 aa  561  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0197  hypothetical protein  38.37 
 
 		 880 aa  558  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2017  hypothetical protein  40.19 
 
 		 880 aa  556  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000248245  normal  0.284056 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0307  hypothetical protein  35.68 
 
 		 993 aa  544  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2186  hypothetical protein  39.86 
 
 		 882 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000183684  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0223  hypothetical protein  40.93 
 
 		 881 aa  528  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1528  hypothetical protein  36.24 
 
 		 984 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0809349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4967  hypothetical protein  34.82 
 
 		 991 aa  493  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.736334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0581  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1009 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.272409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2085  hypothetical protein  34.35 
 
 		 989 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2927  hypothetical protein  34.09 
 
 		 1001 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000253968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1844  hypothetical protein  31.96 
 
 		 1005 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0832694 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01380  hypothetical protein  30.47 
 
 		 1109 aa  412  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.369989  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2144  hypothetical protein  33.91 
 
 		 1099 aa  337  3.9999999999999995e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4667  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1076 aa  314  5.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0836755  hitchhiker  0.00000000312371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1626  hypothetical protein  32.34 
 
 		 1093 aa  276  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0968  conserved hypothetical protein, membrane  30.13 
 
 		 1103 aa  246  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.688922  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2515  hypothetical protein  29.5 
 
 		 652 aa  84  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0758792  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1629  hypothetical protein  28.7 
 
 		 619 aa  81.6  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1489  hypothetical protein  27.39 
 
 		 623 aa  81.3  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124741  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1794  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1245 aa  78.6  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.69552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2597  hypothetical protein  30.96 
 
 		 619 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2684  hypothetical protein  30.54 
 
 		 621 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1651  hypothetical protein  42.35 
 
 		 624 aa  74.7  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1391  hypothetical protein  31.2 
 
 		 619 aa  66.6  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.86997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0932  hypothetical protein  32.89 
 
 		 541 aa  57.8  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.315139  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0051  hypothetical protein  33.33 
 
 		 613 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.062012 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1010  hypothetical protein  20.33 
 
 		 634 aa  52.4  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1942  hypothetical protein  30.26 
 
 		 580 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0873468  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0773  hypothetical protein  30.46 
 
 		 455 aa  49.7  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000042468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>