24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0301 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0301  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 537 aa  1098    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6300  Radical SAM domain protein  36.44 
 
 		 543 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3946  radical SAM domain-containing protein  37.18 
 
 		 537 aa  163  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.488647  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2999  radical SAM domain-containing protein  22 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2471  radical SAM domain-containing protein  22.03 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1602  radical SAM family Fe-S protein  23.55 
 
 		 487 aa  54.3  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1771  radical SAM domain-containing protein  22.77 
 
 		 448 aa  54.3  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  28.27 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0043  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 		 447 aa  48.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.970198  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1368  radical SAM domain-containing protein  23.04 
 
 		 449 aa  48.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.11 
 
 		 522 aa  47.4  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  28.41 
 
 		 524 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 493 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 1250 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0043  radical SAM domain-containing protein  23.16 
 
 		 447 aa  45.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0628937  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2247  Radical SAM domain protein  21.65 
 
 		 465 aa  45.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.53118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1466  Radical SAM domain protein  21.74 
 
 		 467 aa  44.7  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1168  radical SAM family protein  25.76 
 
 		 566 aa  44.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1644  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 468 aa  43.9  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 		 529 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0893  Radical SAM domain protein  30.86 
 
 		 681 aa  43.9  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.878222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  19.58 
 
 		 473 aa  43.9  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1668  Elongator protein 3/MiaB/NifB  36.76 
 
 		 612 aa  43.9  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0607785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19381  Fe-S oxidoreductase  25 
 
 		 537 aa  43.5  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>