181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2471 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2471  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
479 aa  981    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2999  radical SAM domain-containing protein  44.47 
 
 
451 aa  358  8e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2247  Radical SAM domain protein  41.52 
 
 
465 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.53118 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1165  radical SAM domain-containing protein  32.6 
 
 
456 aa  251  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0043  radical SAM domain-containing protein  36.32 
 
 
447 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0628937  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0043  radical SAM domain-containing protein  35.73 
 
 
447 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.970198  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1368  radical SAM domain-containing protein  31.76 
 
 
449 aa  239  1e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1771  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 
448 aa  236  8e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 
524 aa  91.3  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1435  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 
631 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0826343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3370  cobalamin B12-binding  25.95 
 
 
618 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.818313  normal  0.0333946 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2472  radical SAM domain-containing protein  22.59 
 
 
507 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 
451 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  22.18 
 
 
520 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  22.25 
 
 
521 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  22.45 
 
 
502 aa  71.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  22.3 
 
 
552 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0861  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.66 
 
 
561 aa  68.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000604152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1125  Fe-S oxidoreductase  28 
 
 
555 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2407  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 
471 aa  67.8  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  21.68 
 
 
489 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2894  radical SAM family protein  25.71 
 
 
613 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.39 
 
 
484 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1168  radical SAM family protein  27.06 
 
 
566 aa  65.1  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 
564 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  20.49 
 
 
459 aa  62.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1602  radical SAM family Fe-S protein  19.49 
 
 
487 aa  63.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  20.12 
 
 
472 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3401  Radical SAM domain protein  21.23 
 
 
484 aa  61.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  22.59 
 
 
471 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  21.77 
 
 
472 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10215  methyltransferase  24.11 
 
 
437 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4090  radical SAM domain-containing protein  24.11 
 
 
462 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0301  Radical SAM domain protein  22.03 
 
 
537 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  25.77 
 
 
564 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2473  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 
468 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0785227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  23.14 
 
 
472 aa  57.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 
426 aa  57.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3863  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  20.42 
 
 
580 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582854  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2281  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  26.24 
 
 
520 aa  57.8  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.9 
 
 
554 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 
410 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  20.83 
 
 
533 aa  56.2  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  24.3 
 
 
459 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1466  Radical SAM domain protein  24.12 
 
 
467 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159808  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0974  AMP-dependent synthetase and ligase  33.63 
 
 
2142 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411148  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 
600 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0873  radical SAM family Fe-S protein  23.96 
 
 
501 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0874  radical SAM family Fe-S protein  22.02 
 
 
501 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1023  Radical SAM domain protein  24.06 
 
 
467 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0931  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.08 
 
 
465 aa  54.3  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.988397  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  25.4 
 
 
529 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  22.66 
 
 
520 aa  53.9  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  22.68 
 
 
529 aa  53.9  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.06 
 
 
548 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1590  Radical SAM domain protein  24.08 
 
 
488 aa  53.5  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1423  radical SAM/B12 binding domain protein  26.2 
 
 
715 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.623089  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  24.9 
 
 
490 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1644  radical SAM domain-containing protein  22.94 
 
 
468 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  24.87 
 
 
450 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  20.72 
 
 
473 aa  52.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6404  Mg-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase 66kD subunit  25.12 
 
 
534 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  24.33 
 
 
424 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1320  radical SAM domain-containing protein  34.19 
 
 
435 aa  52  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  29.2 
 
 
500 aa  51.6  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  27.75 
 
 
554 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0875  radical SAM family Fe-S protein  27.64 
 
 
495 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1897  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 
483 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.487619  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1302  Radical SAM domain protein  19.72 
 
 
540 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0143596  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  22.95 
 
 
524 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0249  radical SAM domain-containing protein  35.04 
 
 
431 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.178286  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1584  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.48 
 
 
527 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0710  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 
516 aa  50.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  28.47 
 
 
509 aa  50.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  28.32 
 
 
527 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  22.17 
 
 
518 aa  50.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1633  radical SAM domain-containing protein  23.05 
 
 
490 aa  50.1  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478472  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0509  radical SAM domain-containing protein  32.48 
 
 
430 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0195  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
431 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.780626  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2074  radical SAM binding protein  30.06 
 
 
598 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385557  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  22.12 
 
 
470 aa  50.1  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1487  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  20.74 
 
 
567 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1269  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
430 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal  0.258182 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3339  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 
555 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  22.99 
 
 
589 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  21.47 
 
 
556 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1535  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  22.02 
 
 
651 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1516  Radical SAM domain protein  21.17 
 
 
469 aa  49.3  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0112694  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1537  Elongator protein 3/MiaB/NifB  21.2 
 
 
462 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.537529  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.58 
 
 
524 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.39 
 
 
522 aa  49.3  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  25.22 
 
 
527 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 
498 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  22.99 
 
 
589 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0893  Radical SAM domain protein  20.81 
 
 
681 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.878222  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0942  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  21.9 
 
 
528 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162998  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  20.51 
 
 
548 aa  48.5  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0762  Fe-S oxidoreductase  29.33 
 
 
484 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1864  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  20.17 
 
 
565 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0047  Fe-S oxidoreductase  21.75 
 
 
647 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>