280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1771 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1771  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 448 aa  907    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0043  radical SAM domain-containing protein  44.97 
 
 		 447 aa  395  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0628937  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0043  radical SAM domain-containing protein  44.97 
 
 		 447 aa  395  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.970198  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1165  radical SAM domain-containing protein  46.05 
 
 		 456 aa  351  1e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1368  radical SAM domain-containing protein  43.96 
 
 		 449 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2999  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 451 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2471  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 		 479 aa  223  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2247  Radical SAM domain protein  32.08 
 
 		 465 aa  219  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.53118 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1435  radical SAM domain-containing protein  22.83 
 
 		 631 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0826343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2472  radical SAM domain-containing protein  21.9 
 
 		 507 aa  88.6  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3370  cobalamin B12-binding  22.57 
 
 		 618 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.818313  normal  0.0333946 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1125  Fe-S oxidoreductase  29.65 
 
 		 555 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  22.19 
 
 		 518 aa  77  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0861  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.75 
 
 		 561 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000604152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  23.98 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3339  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 555 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  22.71 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  20.89 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  21.16 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  23.15 
 
 		 475 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  23.19 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  27.59 
 
 		 490 aa  70.5  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  23.42 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  21.74 
 
 		 476 aa  70.1  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  24.01 
 
 		 520 aa  70.1  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.19 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  23.44 
 
 		 473 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  23.42 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  23.39 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2167  radical SAM domain-containing protein  24.25 
 
 		 499 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298857  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  24.15 
 
 		 564 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20660  MoaA, NifB, PqqE, radical SAM superfamily protein  23.55 
 
 		 470 aa  67  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  21.56 
 
 		 554 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 		 521 aa  66.6  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1179  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.02 
 
 		 474 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.846685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  23.67 
 
 		 564 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  25.46 
 
 		 524 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  23.67 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4901  radical SAM family protein  23.66 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413487  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3408  radical SAM family protein  23.61 
 
 		 473 aa  65.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  23.67 
 
 		 473 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0353  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.88 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.90319 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1767  radical SAM domain-containing protein  23.58 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580532  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2796  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0536346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0577  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2859  Fe-S oxidoreductase  23.48 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2737  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  23.01 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2201  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  23.14 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1750  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2852  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  21.51 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  22.32 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  23.83 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  23.38 
 
 		 501 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2416  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 469 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2062  putative methyltransferase, or Fe-S oxidoreductase  22.71 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6809  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0385  hypothetical protein  22.71 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  21.79 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  21.55 
 
 		 563 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  19.64 
 
 		 512 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  23.28 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0030  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  21.52 
 
 		 647 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  22.65 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4381  Radical SAM domain protein  22.91 
 
 		 547 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1602  radical SAM family Fe-S protein  25.82 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0304  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  22.57 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  24.3 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  22.91 
 
 		 547 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4494  Radical SAM domain protein  22.91 
 
 		 547 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0820  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 583 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3359  Radical SAM domain protein  23.43 
 
 		 539 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1436  radical SAM domain-containing protein  22.92 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.37868  decreased coverage  0.00181566 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 494 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1633  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  27.31 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 		 497 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3390  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.11 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  21.4 
 
 		 543 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  24.43 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3127  radical SAM domain-containing protein  20.94 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  22.47 
 
 		 547 aa  57  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  23.45 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 		 576 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  24.76 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  24.65 
 
 		 494 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  24.65 
 
 		 494 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 494 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  22.55 
 
 		 533 aa  56.2  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3556  Radical SAM domain protein  21.57 
 
 		 450 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2120  radical SAM domain protein  23.04 
 
 		 476 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.323478  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0047  Fe-S oxidoreductase  21.78 
 
 		 647 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1535  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  21.78 
 
 		 651 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  23.66 
 
 		 502 aa  55.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0033  B12-binding/radical SAM domain-containing protein  21.78 
 
 		 647 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1119  radical SAM domain-containing protein  20.99 
 
 		 525 aa  55.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0138505  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1897  radical SAM domain-containing protein  22.99 
 
 		 483 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.487619  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>