195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1448 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1448  cell divisionFtsK/SpoIIIE  100 
 
 
741 aa  1450    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.464965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0177  cell divisionFtsK/SpoIIIE  47.75 
 
 
731 aa  577  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0972  cell division FtsK/SpoIIIE  44.22 
 
 
719 aa  529  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1929  cell divisionFtsK/SpoIIIE  40.44 
 
 
737 aa  412  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183697  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1519  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.2 
 
 
713 aa  239  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3645  cell divisionFtsK/SpoIIIE  37.99 
 
 
675 aa  208  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6269  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.35 
 
 
703 aa  207  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0138  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.53 
 
 
558 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.885055  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1143  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.09 
 
 
1229 aa  78.2  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.727528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8520  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.44 
 
 
1336 aa  78.2  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0195217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1126  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.79 
 
 
1229 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1153  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.96 
 
 
1229 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.718095  normal  0.251355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2606  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32 
 
 
1438 aa  66.6  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0607  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.66 
 
 
1315 aa  66.6  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5327  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.9 
 
 
523 aa  65.1  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0430668 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28960  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  25.44 
 
 
526 aa  63.9  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1210  cell division protein FtsK/SpoIIIE  27.41 
 
 
1320 aa  62.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.978992  normal  0.356707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4959  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.26 
 
 
1183 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.156858  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5540  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.95 
 
 
517 aa  61.6  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2426  FHA domain containing protein  30.04 
 
 
1346 aa  61.2  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0389758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5523  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.09 
 
 
523 aa  61.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1028  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.56 
 
 
519 aa  60.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0407  cell division FtsK/SpoIIIE  25.43 
 
 
1316 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8101  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  27.89 
 
 
1327 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0331826  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6308  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.34 
 
 
519 aa  59.3  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.835416  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4272  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.04 
 
 
530 aa  58.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000868926  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4268  FHA domain containing protein  29.87 
 
 
1399 aa  58.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2352  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.59 
 
 
750 aa  58.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000570174  decreased coverage  0.00265785 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3790  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.46 
 
 
1346 aa  57.8  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0289284  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7884  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.61 
 
 
1348 aa  57.4  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0456902 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0303  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.42 
 
 
1326 aa  57.8  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313665  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1495  DNA translocase FtsK  23.48 
 
 
1094 aa  57.4  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0066  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.08 
 
 
745 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0075  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.08 
 
 
745 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0751405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0074  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.52 
 
 
740 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.669354  normal  0.0493616 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0059  DNA translocase  23.27 
 
 
995 aa  57  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771975  hitchhiker  0.00000133062 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0145  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.48 
 
 
1094 aa  57.4  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.131308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0056  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.08 
 
 
745 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.627521  hitchhiker  0.00968716 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3724  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.24 
 
 
366 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4753  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.59 
 
 
1315 aa  56.6  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0295916  hitchhiker  0.000421032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23840  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  28.47 
 
 
450 aa  56.2  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000868138  normal  0.396106 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0650  putative cell division protein FtsK  23.13 
 
 
809 aa  56.6  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5430  cell division protein FtsK/SpoIIIE  28.51 
 
 
1303 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0771  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.41 
 
 
742 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.897742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0694  cell division FtsK/SpoIIIE  26.16 
 
 
1336 aa  56.2  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.809205 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4837  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.1 
 
 
1320 aa  55.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.786976  decreased coverage  0.000163862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8474  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.08 
 
 
1349 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0546  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.71 
 
 
733 aa  55.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.803279  hitchhiker  0.0000950013 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2900  cell division FtsK/SpoIIIE  23.75 
 
 
1091 aa  55.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.694821  normal  0.686839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2581  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.78 
 
 
2947 aa  55.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1438  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.71 
 
 
1278 aa  55.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229363  normal  0.229746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2491  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.06 
 
 
1313 aa  54.7  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717331  normal  0.28838 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2695  FHA domain-containing protein  28.25 
 
 
1363 aa  54.7  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6708  FHA domain containing protein  32.6 
 
 
1447 aa  54.3  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.22959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0991  cell division FtsK/SpoIIIE  25.09 
 
 
1340 aa  54.3  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3065  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.91 
 
 
848 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0939  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.5 
 
 
1312 aa  53.5  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0006  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.36 
 
 
501 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168458  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4625  cell division protein FtsK/SpoIIIE  25.47 
 
 
1332 aa  53.5  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18785  normal  0.38778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1568  cell division FtsK/SpoIIIE  27.66 
 
 
433 aa  53.5  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783737  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2112  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.23 
 
 
816 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352662  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3398  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.96 
 
 
560 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0000750555  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10670  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  23.55 
 
 
1011 aa  53.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0694144  unclonable  0.0000000049543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0865  cell division FtsK/SpoIIIE  25.75 
 
 
1335 aa  52.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.351933  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1741  FHA domain-containing protein  25.63 
 
 
1484 aa  53.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.082515  normal  0.707521 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0173  FtsK/SpoIIIE family protein  25.47 
 
 
846 aa  52.4  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.857574  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1730  hypothetical protein  24.07 
 
 
794 aa  52.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2096  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.39 
 
 
726 aa  52.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.775363  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1924  cell division protein FtsK, putative  25.89 
 
 
1725 aa  52  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8557  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.39 
 
 
499 aa  52  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  hitchhiker  0.00205824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4199  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.02 
 
 
894 aa  52  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0219443 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1032  putative cell division protein FtsK  25.89 
 
 
1725 aa  52  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0718321  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0835  putative cell division protein FtsK  25.89 
 
 
1725 aa  52  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.816405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1185  DNA translocase FtsK  25.89 
 
 
1834 aa  52  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0315  putative cell division protein FtsK  25.89 
 
 
1725 aa  52  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10146  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0336  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.51 
 
 
801 aa  51.6  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1344  hypothetical protein  25.89 
 
 
1851 aa  51.6  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06250  putative FtsK/SpoIIIE-like protein  28.68 
 
 
798 aa  51.6  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.996423  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1193  DNA translocase FtsK  25.89 
 
 
1851 aa  51.6  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13905  transmembrane protein  24.58 
 
 
747 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0976  cell division protein FtsK  25.45 
 
 
1784 aa  50.8  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0679  cell division FtsK/SpoIIIE  25.29 
 
 
1335 aa  50.8  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0517102 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5659  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.46 
 
 
388 aa  50.8  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.255861  normal  0.0102641 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04110  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  27.56 
 
 
1360 aa  50.8  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1730  hypothetical protein  23.73 
 
 
794 aa  50.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4810  cell division FtsK/SpoIIIE  26.23 
 
 
1316 aa  50.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116286  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1624  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.92 
 
 
842 aa  50.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000457082  hitchhiker  0.00000117661 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0176  cell division FtsK/SpoIIIE  26.36 
 
 
776 aa  49.7  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_381  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE, S-DNA-T family  26.44 
 
 
814 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3241  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.15 
 
 
902 aa  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.120657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13484  hypothetical protein  27.39 
 
 
1236 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.230373  hitchhiker  0.00886198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3145  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.28 
 
 
1333 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5663  DNA translocase FtsK  25 
 
 
1673 aa  48.9  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793927  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8141  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.39 
 
 
1463 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3705  DNA translocase FtsK  23.11 
 
 
849 aa  49.3  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0060  DNA translocase FtsK  22.99 
 
 
1015 aa  49.3  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.513164  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2344  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25 
 
 
1527 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0427458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0474  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.51 
 
 
1318 aa  49.3  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0770518  decreased coverage  0.00818473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2152  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.05 
 
 
890 aa  49.3  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0378  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.63 
 
 
809 aa  48.9  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.373989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>