More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0059 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1841  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.46 
 
 
826 aa  735    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0705875  normal  0.65267 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0059  DNA translocase  100 
 
 
995 aa  1989    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771975  hitchhiker  0.00000133062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5007  cell divisionFtsK/SpoIIIE  58.28 
 
 
807 aa  670    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0093  FtsK/SpoIIIE family protein  69.79 
 
 
806 aa  694    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1300  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.12 
 
 
853 aa  733    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.728533 
 
 
-
 
NC_002978  WD0120  cell division protein FtsK, putative  63 
 
 
704 aa  649    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0460  putative cell division protein FtsK  72.6 
 
 
819 aa  726    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.83979  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0133  DNA translocase  70.66 
 
 
825 aa  709    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0291  FtsK/SpoIIIE family protein  70.66 
 
 
872 aa  731    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3052  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.83 
 
 
890 aa  740    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1823  putative cell division protein FtsK  65.5 
 
 
874 aa  725    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603207  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1895  cell division protein FtsK, putative  65.5 
 
 
854 aa  725    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.627487  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0530  cell division protein FtsK, putative  72.8 
 
 
821 aa  727    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4908  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.64 
 
 
1221 aa  696    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6133  ftsK cell division protein  68.17 
 
 
954 aa  703    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38419  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2673  cell divisionFtsK/SpoIIIE  86.37 
 
 
894 aa  887    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4424  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.31 
 
 
781 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.843774  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2900  cell division FtsK/SpoIIIE  85.27 
 
 
1091 aa  896    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.694821  normal  0.686839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2053  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.31 
 
 
872 aa  706    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3663  DNA translocase FtsK  58.99 
 
 
797 aa  636    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4120  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.86 
 
 
902 aa  701    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4034  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.05 
 
 
1134 aa  700    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0643851 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2007  cell divisionFtsK/SpoIIIE  59.52 
 
 
912 aa  651    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125828  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0212  cell divisionFtsK/SpoIIIE protein  57.42 
 
 
848 aa  640    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3137  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.34 
 
 
1040 aa  687    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321844  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0083  cell division protein FtsK/SpoIIIE  67.48 
 
 
833 aa  710    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0464  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.2 
 
 
888 aa  719    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1495  DNA translocase FtsK  85.66 
 
 
1094 aa  897    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3768  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.68 
 
 
895 aa  726    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0960  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.56 
 
 
858 aa  730    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2096  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.32 
 
 
726 aa  650    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.775363  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3705  DNA translocase FtsK  68.19 
 
 
849 aa  686    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4092  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.63 
 
 
889 aa  726    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0377  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.92 
 
 
825 aa  693    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0428  DNA translocase FtsK  60.41 
 
 
963 aa  1084    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2377  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.79 
 
 
871 aa  713    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106397  normal  0.445419 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0276  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.54 
 
 
815 aa  720    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251669  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2101  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.39 
 
 
871 aa  709    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0889775  decreased coverage  0.00141598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4404  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.05 
 
 
1091 aa  700    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.508472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4516  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.05 
 
 
1136 aa  697    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0327  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.34 
 
 
881 aa  729    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581381 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.92 
 
 
823 aa  700    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5497  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.19 
 
 
845 aa  710    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.028755 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0090  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.67 
 
 
835 aa  708    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1816  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.03 
 
 
852 aa  709    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4194  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.59 
 
 
951 aa  717    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445928  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0060  DNA translocase FtsK  61.05 
 
 
1015 aa  1103    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.513164  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2669  cell divisionFtsK/SpoIIIE  59.44 
 
 
792 aa  638    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894947  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2891  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.32 
 
 
1153 aa  709    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313219  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4236  ftsK cell division protein  70.47 
 
 
880 aa  725    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1879  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.8 
 
 
882 aa  708    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3235  DNA translocase FtsK  69.85 
 
 
840 aa  725    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0378  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.86 
 
 
809 aa  692    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.373989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3749  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.55 
 
 
1135 aa  694    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.754842  normal  0.0843954 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3557  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.35 
 
 
830 aa  726    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0145  cell divisionFtsK/SpoIIIE  85.85 
 
 
1094 aa  899    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.131308 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2944  DNA translocase FtsK  62.33 
 
 
808 aa  710    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4104  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.33 
 
 
787 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0282  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.82 
 
 
822 aa  701    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0782905  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0890  putative cell division protein FtsK  58.91 
 
 
827 aa  631  1e-179  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.452147  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0435  DNA translocase FtsK  59.4 
 
 
793 aa  620  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0650  putative cell division protein FtsK  62.22 
 
 
809 aa  609  1e-173  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1615  DNA translocase FtsK  52.08 
 
 
1477 aa  591  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.962365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1285  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.96 
 
 
799 aa  549  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139445  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3178  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.8 
 
 
784 aa  547  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28220  Cell division protein FtsK  39.61 
 
 
973 aa  548  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41946  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3382  DNA translocase FtsK  53.79 
 
 
776 aa  544  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2004  DNA translocase FtsK  54.55 
 
 
769 aa  544  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2089  cell division FtsK/SpoIIIE  47.59 
 
 
1369 aa  545  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123454 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2720  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.79 
 
 
776 aa  545  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5363  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.23 
 
 
787 aa  542  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1550  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.06 
 
 
866 aa  538  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4392  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.34 
 
 
757 aa  537  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3211  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.55 
 
 
818 aa  536  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.129812  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0835  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.1 
 
 
769 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.65 
 
 
763 aa  535  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.947558  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1193  DNA translocase FtsK  53.82 
 
 
1851 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0790  cell division protein FtsK  55.28 
 
 
822 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2122  cell division protein FtsK  55.28 
 
 
822 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2344  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.64 
 
 
1527 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0427458 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1344  hypothetical protein  53.82 
 
 
1851 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3077  cell division ftsk transmembrane protein  55.28 
 
 
822 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2990  DNA translocase FtsK  55.28 
 
 
822 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0176  cell division FtsK/SpoIIIE  52.76 
 
 
776 aa  533  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3426  DNA translocase FtsK  53.59 
 
 
779 aa  534  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.643705  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2622  cell division protein FtsK  55.28 
 
 
768 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.436072  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1990  cell division protein FtsK  55.28 
 
 
768 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2321  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.64 
 
 
1527 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.800211  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3043  DNA translocase FtsK  55.28 
 
 
768 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0835  putative cell division protein FtsK  53.82 
 
 
1725 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.816405  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1759  cell division FtsK/SpoIIIE  54.27 
 
 
777 aa  529  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1924  cell division protein FtsK, putative  53.82 
 
 
1725 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4078  DNA translocase FtsK  54.55 
 
 
769 aa  531  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5663  DNA translocase FtsK  54.76 
 
 
1673 aa  532  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793927  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0367  DNA translocase FtsK  54.27 
 
 
760 aa  531  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219387  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1561  cell division protein FtsK  55.28 
 
 
819 aa  531  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1709  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.64 
 
 
1527 aa  532  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1185  DNA translocase FtsK  53.82 
 
 
1834 aa  532  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1963  DNA translocase FtsK  38.02 
 
 
914 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000218677  normal  0.918259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2013  DNA translocase FtsK  38.12 
 
 
913 aa  532  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00817822  normal  0.0372318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>