More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0060 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3663  DNA translocase FtsK  63.89 
 
 		 797 aa  641    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4194  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.3 
 
 		 951 aa  709    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5007  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60.82 
 
 		 807 aa  696    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2900  cell division FtsK/SpoIIIE  85.52 
 
 		 1091 aa  902    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.694821  normal  0.686839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2053  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.37 
 
 		 872 aa  691    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0120  cell division protein FtsK, putative  59.96 
 
 		 704 aa  652    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4404  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.53 
 
 		 1091 aa  688    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508472 
 
 
-
 
NC_004310  BR1895  cell division protein FtsK, putative  68.28 
 
 		 854 aa  734    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.627487  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0530  cell division protein FtsK, putative  71.14 
 
 		 821 aa  723    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1300  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.85 
 
 		 853 aa  726    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728533 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4236  ftsK cell division protein  69.64 
 
 		 880 aa  717    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0093  FtsK/SpoIIIE family protein  66.4 
 
 		 806 aa  683    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0960  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.28 
 
 		 858 aa  735    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2673  cell divisionFtsK/SpoIIIE  85.25 
 
 		 894 aa  885    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6133  ftsK cell division protein  59.48 
 
 		 954 aa  703    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38419  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1841  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.08 
 
 		 826 aa  724    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0705875  normal  0.65267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2101  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60.93 
 
 		 871 aa  709    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0889775  decreased coverage  0.00141598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3137  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.59 
 
 		 1040 aa  676    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321844  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4092  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.13 
 
 		 889 aa  729    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4908  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.93 
 
 		 1221 aa  690    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0083  cell division protein FtsK/SpoIIIE  65.49 
 
 		 833 aa  698    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4104  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.84 
 
 		 787 aa  695    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4516  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.72 
 
 		 1136 aa  686    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1495  DNA translocase FtsK  85.69 
 
 		 1094 aa  900    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4424  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.33 
 
 		 781 aa  691    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.843774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0327  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.21 
 
 		 881 aa  721    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0133  DNA translocase  68.24 
 
 		 825 aa  705    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0291  FtsK/SpoIIIE family protein  68.39 
 
 		 872 aa  712    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5497  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.11 
 
 		 845 aa  692    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.028755 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0145  cell divisionFtsK/SpoIIIE  85.69 
 
 		 1094 aa  900    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.131308 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3705  DNA translocase FtsK  67.13 
 
 		 849 aa  678    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0282  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.37 
 
 		 822 aa  701    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0782905  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0377  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.73 
 
 		 825 aa  697    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0428  DNA translocase FtsK  58.8 
 
 		 963 aa  1106    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0276  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.41 
 
 		 815 aa  715    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251669  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0059  DNA translocase  61.61 
 
 		 995 aa  1089    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771975  hitchhiker  0.00000133062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4120  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.33 
 
 		 902 aa  686    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1823  putative cell division protein FtsK  68.1 
 
 		 874 aa  733    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603207  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.39 
 
 		 823 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0090  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.74 
 
 		 835 aa  702    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3557  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.92 
 
 		 830 aa  726    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0060  DNA translocase FtsK  100 
 
 		 1015 aa  2055    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.513164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2669  cell divisionFtsK/SpoIIIE  61.21 
 
 		 792 aa  650    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3749  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.79 
 
 		 1135 aa  683    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.754842  normal  0.0843954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1879  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.46 
 
 		 882 aa  697    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3235  DNA translocase FtsK  68.54 
 
 		 840 aa  721    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2377  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60.66 
 
 		 871 aa  702    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106397  normal  0.445419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3768  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.14 
 
 		 895 aa  732    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3052  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.72 
 
 		 890 aa  741    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0464  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.64 
 
 		 888 aa  723    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0460  putative cell division protein FtsK  70.94 
 
 		 819 aa  722    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.83979  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0378  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.4 
 
 		 809 aa  676    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.373989  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2944  DNA translocase FtsK  65.36 
 
 		 808 aa  697    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1816  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.72 
 
 		 852 aa  696    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4034  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.34 
 
 		 1134 aa  686    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643851 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2007  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.35 
 
 		 912 aa  628  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0435  DNA translocase FtsK  59.89 
 
 		 793 aa  626  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2096  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.08 
 
 		 726 aa  623  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.775363  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0212  cell divisionFtsK/SpoIIIE protein  59.88 
 
 		 848 aa  622  1e-176  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0890  putative cell division protein FtsK  58.49 
 
 		 827 aa  619  1e-176  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.452147  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0650  putative cell division protein FtsK  61.12 
 
 		 809 aa  598  1e-169  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1615  DNA translocase FtsK  47.68 
 
 		 1477 aa  591  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962365 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2004  DNA translocase FtsK  57.6 
 
 		 769 aa  552  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5363  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.43 
 
 		 787 aa  546  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0835  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.75 
 
 		 769 aa  548  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2720  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.1 
 
 		 776 aa  545  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3211  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.19 
 
 		 818 aa  543  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.129812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3382  DNA translocase FtsK  54.1 
 
 		 776 aa  546  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4078  DNA translocase FtsK  55.36 
 
 		 769 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3178  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.71 
 
 		 784 aa  545  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0790  cell division protein FtsK  55.13 
 
 		 822 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2122  cell division protein FtsK  55.13 
 
 		 822 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1285  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.74 
 
 		 799 aa  542  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139445  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3799  DNA translocase FtsK  53.53 
 
 		 781 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0936  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.75 
 
 		 769 aa  539  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.470674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2622  cell division protein FtsK  55.34 
 
 		 768 aa  539  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.436072  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.62 
 
 		 763 aa  537  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.947558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3077  cell division ftsk transmembrane protein  55.13 
 
 		 822 aa  539  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1990  cell division protein FtsK  55.34 
 
 		 768 aa  539  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1561  cell division protein FtsK  55.13 
 
 		 819 aa  537  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0847  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.56 
 
 		 769 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2990  DNA translocase FtsK  55.13 
 
 		 822 aa  539  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3043  DNA translocase FtsK  55.34 
 
 		 768 aa  539  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1827  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.11 
 
 		 789 aa  535  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.346925  hitchhiker  0.00000783388 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2423  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.36 
 
 		 779 aa  534  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3426  DNA translocase FtsK  55.13 
 
 		 779 aa  535  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.643705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0496  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.36 
 
 		 769 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0975  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.36 
 
 		 769 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1038  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.6 
 
 		 770 aa  531  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.648604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1759  cell division FtsK/SpoIIIE  54.3 
 
 		 777 aa  529  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3441  DNA translocase FtsK  54.21 
 
 		 771 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0685  DNA translocase FtsK  51.3 
 
 		 775 aa  531  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579249  normal  0.40602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1550  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.24 
 
 		 866 aa  530  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4392  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.92 
 
 		 757 aa  528  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0176  cell division FtsK/SpoIIIE  52.32 
 
 		 776 aa  526  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1693  DNA translocase FtsK  51.16 
 
 		 782 aa  528  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.477366 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0690  cell division FtsK/SpoIIIE  54.81 
 
 		 770 aa  528  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1120  DNA translocase FtsK  53.16 
 
 		 777 aa  528  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1161  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.26 
 
 		 770 aa  525  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.112052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2321  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.76 
 
 		 1527 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.800211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>