More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3398 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3398  cell divisionFtsK/SpoIIIE  100 
 
 
560 aa  1074    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0000750555  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5523  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.89 
 
 
523 aa  360  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5540  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.44 
 
 
517 aa  352  8.999999999999999e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1028  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.01 
 
 
519 aa  349  7e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6308  cell divisionFtsK/SpoIIIE  50.9 
 
 
519 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.835416  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5327  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.62 
 
 
523 aa  339  7e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0430668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3167  cell divisionFtsK/SpoIIIE  46.92 
 
 
481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.859597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3229  cell divisionFtsK/SpoIIIE  46.92 
 
 
481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0446654  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3179  cell divisionFtsK/SpoIIIE  46.92 
 
 
481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5592  cell division FtsK/SpoIIIE  45.84 
 
 
480 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5993  cell divisionFtsK/SpoIIIE  45.84 
 
 
480 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000693624 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5289  cell division protein FtsK/SpoIIIE  45.04 
 
 
476 aa  280  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0634  cell division FtsK/SpoIIIE  42.96 
 
 
460 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8557  cell divisionFtsK/SpoIIIE  42.72 
 
 
499 aa  267  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  hitchhiker  0.00205824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0696  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  48.43 
 
 
484 aa  266  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4272  cell divisionFtsK/SpoIIIE  44.72 
 
 
530 aa  260  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000868926  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0152  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  45.3 
 
 
481 aa  256  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3034  cell divisionFtsK/SpoIIIE  44.23 
 
 
474 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0042  cell divisionFtsK/SpoIIIE  42.22 
 
 
455 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1142  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.88 
 
 
409 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6361  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.72 
 
 
491 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0921  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE-related protein  38.08 
 
 
483 aa  210  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1288  cell divisionFtsK/SpoIIIE  35.32 
 
 
456 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23840  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  36.34 
 
 
450 aa  177  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000868138  normal  0.396106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1568  cell division FtsK/SpoIIIE  36.27 
 
 
433 aa  170  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783737  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1113  cell divisionFtsK/SpoIIIE  35.36 
 
 
460 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0138  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.9 
 
 
558 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.885055  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28960  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  32.95 
 
 
526 aa  87.8  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0593  cell division protein FtsK/SpoIIIE  28.49 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000762932  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8666  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  31.43 
 
 
450 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0084  cell division FtsK/SpoIIIE  29.86 
 
 
460 aa  79  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0797  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.82 
 
 
669 aa  68.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08760  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.18 
 
 
758 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00860549  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1381  cell division protein  24.03 
 
 
804 aa  65.1  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6269  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.14 
 
 
703 aa  63.9  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1448  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.96 
 
 
741 aa  63.9  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.464965 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0439  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.05 
 
 
763 aa  63.9  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0859833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4530  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.36 
 
 
447 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0939  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.32 
 
 
1312 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2586  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.38 
 
 
716 aa  62.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0701867  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1821  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE related protein  23.66 
 
 
755 aa  62.4  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1529  FtsK/SpoIIIE family protein  24.51 
 
 
816 aa  62  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0393755  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2583  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.04 
 
 
412 aa  62  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000415751  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1362  cell division protein FtsK/SpoIIIE  23.99 
 
 
788 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.174513  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1336  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.99 
 
 
788 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599515  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4516  cell divisionFtsK/SpoIIIE  22.68 
 
 
1136 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4034  cell divisionFtsK/SpoIIIE  22.68 
 
 
1134 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0643851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4404  cell divisionFtsK/SpoIIIE  22.68 
 
 
1091 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.508472 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0581  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.83 
 
 
776 aa  60.1  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1420  cell division FtsK/SpoIIIE  24.17 
 
 
776 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.538178  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5334  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.88 
 
 
1736 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0405049  normal  0.265694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3749  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.16 
 
 
1135 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.754842  normal  0.0843954 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1465  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.2 
 
 
822 aa  59.3  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7884  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.2 
 
 
1348 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0456902 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0843  FtsK/SpoIIIE family protein  23.48 
 
 
797 aa  58.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1944  cell division FtsK/SpoIIIE  25.42 
 
 
726 aa  58.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1861  cell division protein FtsK/SpoIIIE  26.24 
 
 
930 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2377  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23 
 
 
871 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106397  normal  0.445419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3828  stage III sporulation protein E  23.91 
 
 
793 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000134118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3893  stage III sporulation protein E  23.91 
 
 
793 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0045654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3645  stage III sporulation protein E  23.91 
 
 
793 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00104928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3535  stage III sporulation protein E (DNA translocase SpoIIIE)  23.91 
 
 
793 aa  58.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000424384  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3553  stage III sporulation protein E (DNA translocase SpoIIIE)  23.91 
 
 
793 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0180152  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3806  stage III sporulation protein E  23.91 
 
 
793 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98433e-27 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3930  stage III sporulation protein E  23.91 
 
 
793 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000252394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3842  stage III sporulation protein E  23.91 
 
 
793 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000180384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2581  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.36 
 
 
2947 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3564  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.47 
 
 
794 aa  58.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000378493  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0837  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.8 
 
 
727 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1654  ATPase  24.39 
 
 
533 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.815556  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1406  DNA translocase FtsK  24.19 
 
 
793 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000239952  hitchhiker  0.000000381698 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1295  DNA translocase FtsK  25.87 
 
 
768 aa  57.4  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.65138  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1955  FtsK/SpoIIIE family protein  23.78 
 
 
788 aa  57.4  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0484532  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2101  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.22 
 
 
871 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0889775  decreased coverage  0.00141598 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2445  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.92 
 
 
793 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000220657  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1463  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.78 
 
 
809 aa  57  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2891  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.4 
 
 
1153 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313219  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1215  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.57 
 
 
455 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00586249  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1438  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.57 
 
 
1278 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229363  normal  0.229746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1414  DNA translocase FtsK  24.9 
 
 
1244 aa  56.6  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0287873  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0650  putative cell division protein FtsK  22.01 
 
 
809 aa  57  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2954  cell divisionFtsK/SpoIIIE  22.63 
 
 
874 aa  57  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0907  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.95 
 
 
744 aa  56.6  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00620171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1296  FHA domain-containing protein  30.05 
 
 
1493 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2053  cell divisionFtsK/SpoIIIE  22.75 
 
 
872 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4588  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.13 
 
 
1812 aa  56.6  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1816  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.4 
 
 
852 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1445  DNA translocase FtsK  24.91 
 
 
1107 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64751  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4908  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.11 
 
 
1221 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1757  DNA translocase FtsK  27.43 
 
 
831 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0371  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.46 
 
 
910 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.165249 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1184  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE-related protein  28.28 
 
 
1807 aa  56.2  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274643  normal  0.284546 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0175  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE-related protein  28.28 
 
 
1807 aa  56.2  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.78855  hitchhiker  0.000743422 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2740  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.31 
 
 
737 aa  55.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.846429  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0679  cell division FtsK/SpoIIIE  27.93 
 
 
1335 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0517102 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2720  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.15 
 
 
776 aa  55.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3838  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.16 
 
 
636 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5497  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.11 
 
 
845 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.028755 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3382  DNA translocase FtsK  26.15 
 
 
776 aa  55.5  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4753  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.8 
 
 
1315 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0295916  hitchhiker  0.000421032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>