More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4272 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_4272  cell divisionFtsK/SpoIIIE  100 
 
 
530 aa  1041    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000868926  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0042  cell divisionFtsK/SpoIIIE  47.6 
 
 
455 aa  317  4e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5289  cell division protein FtsK/SpoIIIE  45.95 
 
 
476 aa  317  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0634  cell division FtsK/SpoIIIE  47.07 
 
 
460 aa  306  8.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5523  cell divisionFtsK/SpoIIIE  43.23 
 
 
523 aa  296  6e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0696  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  43.05 
 
 
484 aa  296  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6308  cell divisionFtsK/SpoIIIE  42.99 
 
 
519 aa  294  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.835416  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8557  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.65 
 
 
499 aa  293  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  hitchhiker  0.00205824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0152  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  43.82 
 
 
481 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1028  cell divisionFtsK/SpoIIIE  42.27 
 
 
519 aa  288  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5327  cell divisionFtsK/SpoIIIE  43.38 
 
 
523 aa  287  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0430668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5540  cell divisionFtsK/SpoIIIE  44.7 
 
 
517 aa  284  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5592  cell division FtsK/SpoIIIE  38.86 
 
 
480 aa  279  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5993  cell divisionFtsK/SpoIIIE  38.86 
 
 
480 aa  279  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000693624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0921  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE-related protein  44.42 
 
 
483 aa  272  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3167  cell divisionFtsK/SpoIIIE  37.91 
 
 
481 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.859597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3229  cell divisionFtsK/SpoIIIE  37.91 
 
 
481 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0446654  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3179  cell divisionFtsK/SpoIIIE  37.91 
 
 
481 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6361  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.94 
 
 
491 aa  262  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3034  cell divisionFtsK/SpoIIIE  40.32 
 
 
474 aa  253  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3398  cell divisionFtsK/SpoIIIE  47.38 
 
 
560 aa  248  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0000750555  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1142  cell divisionFtsK/SpoIIIE  42.01 
 
 
409 aa  210  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1288  cell divisionFtsK/SpoIIIE  35.51 
 
 
456 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23840  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  33.74 
 
 
450 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000868138  normal  0.396106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1113  cell divisionFtsK/SpoIIIE  37.13 
 
 
460 aa  189  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1568  cell division FtsK/SpoIIIE  37.9 
 
 
433 aa  174  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783737  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0138  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.69 
 
 
558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.885055  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8666  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  31.4 
 
 
450 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0084  cell division FtsK/SpoIIIE  29.5 
 
 
460 aa  99  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0593  cell division protein FtsK/SpoIIIE  29.17 
 
 
446 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000762932  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4530  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.83 
 
 
447 aa  71.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5334  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.36 
 
 
1736 aa  67.4  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0405049  normal  0.265694 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1184  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE-related protein  30.06 
 
 
1807 aa  66.6  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274643  normal  0.284546 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0175  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE-related protein  30.06 
 
 
1807 aa  66.6  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.78855  hitchhiker  0.000743422 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28960  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  32.35 
 
 
526 aa  65.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4588  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.55 
 
 
1812 aa  63.5  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0173  FtsK/SpoIIIE family protein  24.93 
 
 
846 aa  60.5  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.857574  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3645  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.69 
 
 
675 aa  60.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0439  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.83 
 
 
763 aa  59.3  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0859833 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4823  ftsk/spoiiie family protein  24.92 
 
 
1270 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000514278  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1154  DNA segregation ATPase FtsK  26.43 
 
 
787 aa  58.5  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.66945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0435  ftsk/spoiiie family protein  24.92 
 
 
1356 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.099087  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2016  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.02 
 
 
810 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000167255  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1448  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.04 
 
 
741 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.464965 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1302  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.56 
 
 
747 aa  58.2  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.193601  normal  0.183958 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4832  FtsK/SpoIIIE family protein  24.92 
 
 
1266 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0790517  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl100  DNA translocase (stage III sporulation protein E)  23.4 
 
 
953 aa  57.8  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4801  ftsk/spoiiie family protein  24.92 
 
 
1359 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0440152  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0112  cell division protein FtsK, putative  22.7 
 
 
794 aa  57.8  0.0000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1215  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.52 
 
 
455 aa  57.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00586249  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0660  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE related protein  25.27 
 
 
788 aa  57.8  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.437919  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5140  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.97 
 
 
648 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.76274e-16 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1529  FtsK/SpoIIIE family protein  24.28 
 
 
816 aa  57.4  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0393755  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0263  DNA translocase FtsK  25.55 
 
 
787 aa  57  0.0000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0538344  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2066  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.15 
 
 
776 aa  57  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21520  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  28.94 
 
 
1488 aa  57  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4440  cell division protein  24.92 
 
 
1266 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0418  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.06 
 
 
814 aa  57  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.124101  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1944  cell division FtsK/SpoIIIE  24.19 
 
 
726 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4147  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.57 
 
 
1502 aa  56.6  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3351  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.99 
 
 
1035 aa  56.6  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2359  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.02 
 
 
825 aa  56.6  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.967917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4807  ftsk/spoiiie family protein  24.92 
 
 
1284 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4520  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.92 
 
 
1393 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4585  FtsK/SpoIIIE family protein  24.92 
 
 
1311 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4422  cell division protein  24.92 
 
 
1338 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2445  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.92 
 
 
793 aa  56.2  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000220657  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1463  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.03 
 
 
809 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4940  FtsK/SpoIIIE family protein  24.92 
 
 
1311 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1362  cell division protein FtsK/SpoIIIE  31.55 
 
 
788 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.174513  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1336  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.55 
 
 
788 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599515  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1821  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE related protein  23.08 
 
 
755 aa  55.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1124  DNA translocase FtsK  25.95 
 
 
765 aa  54.7  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2740  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.16 
 
 
737 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.846429  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08760  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.47 
 
 
758 aa  54.7  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00860549  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2583  cell divisionFtsK/SpoIIIE  21.82 
 
 
412 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000415751  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2112  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.26 
 
 
816 aa  54.7  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352662  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1351  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.4 
 
 
817 aa  54.3  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410442 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1295  DNA translocase FtsK  24.26 
 
 
768 aa  54.3  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.65138  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0843  FtsK/SpoIIIE family protein  29.73 
 
 
797 aa  53.9  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3893  stage III sporulation protein E  24.92 
 
 
793 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0045654  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1034  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.81 
 
 
918 aa  53.9  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.231031  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3564  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.29 
 
 
794 aa  53.9  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000378493  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1816  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.59 
 
 
789 aa  53.9  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000645592  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6269  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.81 
 
 
703 aa  53.5  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1406  DNA translocase FtsK  24.92 
 
 
793 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000239952  hitchhiker  0.000000381698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23270  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  25.81 
 
 
885 aa  53.5  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.980529  normal  0.0441248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1302  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  27.3 
 
 
1528 aa  53.5  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3828  stage III sporulation protein E  24.92 
 
 
793 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000134118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3535  stage III sporulation protein E (DNA translocase SpoIIIE)  24.92 
 
 
793 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000424384  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3553  stage III sporulation protein E (DNA translocase SpoIIIE)  24.92 
 
 
793 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0180152  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8141  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.61 
 
 
1463 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1654  ATPase  30.11 
 
 
533 aa  53.5  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.815556  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1393  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.16 
 
 
821 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.581217 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3930  stage III sporulation protein E  24.92 
 
 
793 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000252394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3842  stage III sporulation protein E  24.92 
 
 
793 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000180384  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1438  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.42 
 
 
1278 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229363  normal  0.229746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2254  cell division FtsK/SpoIIIE  25.94 
 
 
814 aa  53.5  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0463654  normal  0.361688 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1296  FtsK/SpoIIIE family protein  25 
 
 
693 aa  52.8  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.557352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3806  stage III sporulation protein E  24.92 
 
 
793 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98433e-27 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>