29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0177 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0972  cell division FtsK/SpoIIIE  52.07 
 
 		 719 aa  655    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0177  cell divisionFtsK/SpoIIIE  100 
 
 		 731 aa  1462    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1448  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.32 
 
 		 741 aa  579  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.464965 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1929  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.85 
 
 		 737 aa  411  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183697  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1519  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.38 
 
 		 713 aa  231  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6269  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.9 
 
 		 703 aa  229  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3645  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.68 
 
 		 675 aa  188  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0006  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.22 
 
 		 501 aa  57.4  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1741  FHA domain-containing protein  28.77 
 
 		 1484 aa  56.6  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.082515  normal  0.707521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0138  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.36 
 
 		 558 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.885055  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3790  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.3 
 
 		 1346 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0289284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1184  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE-related protein  29.17 
 
 		 1807 aa  48.9  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274643  normal  0.284546 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0175  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE-related protein  29.17 
 
 		 1807 aa  48.9  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.78855  hitchhiker  0.000743422 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0009  FtsK/SpoIIIE family protein  24.51 
 
 		 280 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5859  DNA segregation ATPase  26.51 
 
 		 388 aa  48.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0412  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.4 
 
 		 1604 aa  47.8  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.62711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2426  FHA domain containing protein  27.24 
 
 		 1346 aa  47.8  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0389758 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23840  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  27.36 
 
 		 450 aa  47  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000868138  normal  0.396106 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2581  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.17 
 
 		 2947 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2436  DNA translocase FtsK  26.42 
 
 		 1085 aa  45.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.277561  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4199  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.37 
 
 		 894 aa  45.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219443 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1495  DNA translocase FtsK  23.93 
 
 		 1094 aa  45.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0435  DNA translocase FtsK  25 
 
 		 793 aa  45.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0145  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.93 
 
 		 1094 aa  45.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.131308 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1285  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.05 
 
 		 799 aa  44.3  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139445  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5659  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.12 
 
 		 388 aa  44.3  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.255861  normal  0.0102641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4268  FHA domain containing protein  33.33 
 
 		 1399 aa  44.3  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3211  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.77 
 
 		 818 aa  44.3  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.129812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6708  FHA domain containing protein  28.42 
 
 		 1447 aa  44.3  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.22959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>