26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3216 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3216  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  344  3e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629632  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1692  hypothetical protein  77.01 
 
 		 164 aa  254  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00793955  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1332  hypothetical protein  52.26 
 
 		 143 aa  141  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0774842  normal  0.287418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5267  hypothetical protein  45.64 
 
 		 135 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.283162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15250  hypothetical protein  44.12 
 
 		 134 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0118972  normal  0.286282 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2280  secreted protein  45.24 
 
 		 124 aa  99  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0151568  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2017  secreted protein  43.65 
 
 		 124 aa  95.9  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000921517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3160  secreted protein  45.97 
 
 		 141 aa  94.7  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1687  hypothetical protein  44.44 
 
 		 120 aa  94  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.496832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2376  hypothetical protein  36.77 
 
 		 141 aa  91.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1353  hypothetical protein  40.83 
 
 		 126 aa  87.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17670  hypothetical protein  41.88 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00814733  normal  0.12232 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0618  hypothetical protein  36.11 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.787668  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1816  hypothetical protein  43.2 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3880  hypothetical protein  39.05 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.628101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0372  hypothetical protein  33.12 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2073  putative secreted protein  33.87 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2049  hypothetical protein  31.75 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3086  putative secreted protein  35.58 
 
 		 130 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6096  hypothetical protein  32.56 
 
 		 128 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0752987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4329  hypothetical protein  30.19 
 
 		 149 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2012  hypothetical protein  43.7 
 
 		 122 aa  67  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0507518  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1826  hypothetical protein  39.13 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159099  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2133  hypothetical protein  35.83 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000026449  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1817  hypothetical protein  33.82 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.553588  hitchhiker  0.0000137975 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0547  hypothetical protein  31.65 
 
 		 146 aa  40.8  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>