30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0547 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0547  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  298  1e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0433  methyl-accepting chemotaxis-like protein  44.04 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000756521  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1723  methyl-accepting chemotaxis-like protein  43.14 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0640  methyl-accepting chemotaxis-like protein  40.37 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.112665  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0738  hypothetical protein  38.38 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.70209  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0682  methyl-accepting chemotaxis-like protein  33.11 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.592339  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2737  protein of unknown function DUF948  37.93 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3345  hypothetical protein  27.73 
 
 
167 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.303189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4431  hypothetical protein  26.02 
 
 
170 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1687  hypothetical protein  34.88 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.496832  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0721  methyl-accepting chemotaxis-like domain-containing protein  34.43 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000989217  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1332  hypothetical protein  32.22 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0774842  normal  0.287418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6096  hypothetical protein  31.87 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0752987  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4510  hypothetical protein  25 
 
 
169 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2049  hypothetical protein  36.76 
 
 
155 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4818  hypothetical protein  25 
 
 
170 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4798  hypothetical protein  25 
 
 
170 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4814  hypothetical protein  25 
 
 
170 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4932  hypothetical protein  25 
 
 
170 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4413  hypothetical protein  25 
 
 
170 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4578  hypothetical protein  25 
 
 
170 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15250  hypothetical protein  32.98 
 
 
134 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0118972  normal  0.286282 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4794  hypothetical protein  24.17 
 
 
170 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0444  hypothetical protein  24.17 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1692  hypothetical protein  31.25 
 
 
164 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00793955  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5267  hypothetical protein  32.89 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.283162  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2376  hypothetical protein  27.84 
 
 
141 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1353  hypothetical protein  29.55 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17670  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  40.4  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00814733  normal  0.12232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3216  hypothetical protein  31.65 
 
 
176 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629632  normal  0.831547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>