26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6096 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6096  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  250  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0752987  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2049  hypothetical protein  56.41 
 
 
155 aa  140  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2073  putative secreted protein  47.66 
 
 
130 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2376  hypothetical protein  42.98 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2133  hypothetical protein  50 
 
 
139 aa  92  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000026449  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3086  putative secreted protein  49.57 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15250  hypothetical protein  42.24 
 
 
134 aa  89  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0118972  normal  0.286282 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17670  hypothetical protein  39.32 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00814733  normal  0.12232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1687  hypothetical protein  39.29 
 
 
120 aa  83.6  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.496832  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2280  secreted protein  39.47 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0151568  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1332  hypothetical protein  35.43 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0774842  normal  0.287418 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2017  secreted protein  40.35 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000921517 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1353  hypothetical protein  34.45 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1816  hypothetical protein  37.04 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345729  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5267  hypothetical protein  31.06 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.283162  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1692  hypothetical protein  31.01 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00793955  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0618  hypothetical protein  31.9 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.787668  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3216  hypothetical protein  30.23 
 
 
176 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629632  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3160  secreted protein  40 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2012  hypothetical protein  32.08 
 
 
122 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0507518  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0372  hypothetical protein  26.61 
 
 
148 aa  51.2  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4329  hypothetical protein  27.73 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1826  hypothetical protein  32.85 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159099  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0547  hypothetical protein  31.87 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3880  hypothetical protein  35.43 
 
 
167 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.628101  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1817  hypothetical protein  29.91 
 
 
153 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.553588  hitchhiker  0.0000137975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>