26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3086 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3086  putative secreted protein  100 
 
 
130 aa  252  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2073  putative secreted protein  71.65 
 
 
130 aa  187  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6096  hypothetical protein  47.66 
 
 
128 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0752987  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2049  hypothetical protein  46.09 
 
 
155 aa  103  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15250  hypothetical protein  41.73 
 
 
134 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0118972  normal  0.286282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5267  hypothetical protein  40.31 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.283162  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1353  hypothetical protein  36.51 
 
 
126 aa  92  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1332  hypothetical protein  39.29 
 
 
143 aa  89.4  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0774842  normal  0.287418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2133  hypothetical protein  42.24 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000026449  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1687  hypothetical protein  41.67 
 
 
120 aa  87.4  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.496832  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17670  hypothetical protein  38.18 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00814733  normal  0.12232 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2017  secreted protein  37.9 
 
 
124 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000921517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3216  hypothetical protein  37.1 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629632  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1692  hypothetical protein  36.29 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00793955  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2376  hypothetical protein  34.78 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2280  secreted protein  35.48 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0151568  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0618  hypothetical protein  38.1 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.787668  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1816  hypothetical protein  38.05 
 
 
123 aa  82  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345729  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3160  secreted protein  33.91 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3880  hypothetical protein  38.76 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.628101  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0372  hypothetical protein  29.37 
 
 
148 aa  60.5  0.000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1826  hypothetical protein  34.85 
 
 
153 aa  58.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159099  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2012  hypothetical protein  35.19 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0507518  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4329  hypothetical protein  31.3 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189531 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1817  hypothetical protein  31.9 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.553588  hitchhiker  0.0000137975 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0547  hypothetical protein  26.97 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>