24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2133 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2133  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  269  9e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000026449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6096  hypothetical protein  50 
 
 
128 aa  110  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0752987  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2376  hypothetical protein  39.01 
 
 
141 aa  106  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2049  hypothetical protein  40.13 
 
 
155 aa  104  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17670  hypothetical protein  45.37 
 
 
124 aa  101  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00814733  normal  0.12232 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2073  putative secreted protein  41.04 
 
 
130 aa  97.1  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1816  hypothetical protein  45.05 
 
 
123 aa  92  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345729  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1687  hypothetical protein  38.21 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.496832  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1332  hypothetical protein  38.81 
 
 
143 aa  90.9  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0774842  normal  0.287418 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1353  hypothetical protein  37.72 
 
 
126 aa  90.1  9e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3086  putative secreted protein  41.67 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15250  hypothetical protein  39.64 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0118972  normal  0.286282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1692  hypothetical protein  34.15 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00793955  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2017  secreted protein  38.71 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000921517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3216  hypothetical protein  34.67 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629632  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2280  secreted protein  38.21 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0151568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5267  hypothetical protein  36.04 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.283162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2012  hypothetical protein  42.53 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0507518  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3160  secreted protein  41.82 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0618  hypothetical protein  31.73 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.787668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4329  hypothetical protein  35.82 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1826  hypothetical protein  36.08 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159099  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1817  hypothetical protein  30.43 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.553588  hitchhiker  0.0000137975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3880  hypothetical protein  33.63 
 
 
167 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.628101  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>