21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4329 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4329  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  288  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2376  hypothetical protein  47.52 
 
 		 141 aa  131  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1332  hypothetical protein  31.58 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0774842  normal  0.287418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1692  hypothetical protein  31.52 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00793955  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3216  hypothetical protein  32.72 
 
 		 176 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629632  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2017  secreted protein  29.84 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000921517 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2280  secreted protein  31.62 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0151568  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2049  hypothetical protein  26.72 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2133  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000026449  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17670  hypothetical protein  36.19 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00814733  normal  0.12232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6096  hypothetical protein  27.73 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0752987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1816  hypothetical protein  34.29 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3086  putative secreted protein  32.63 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1687  hypothetical protein  33.03 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.496832  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2073  putative secreted protein  26.09 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5267  hypothetical protein  35.21 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.283162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2012  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0507518  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1353  hypothetical protein  31.43 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15250  hypothetical protein  31.9 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0118972  normal  0.286282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3880  hypothetical protein  32.5 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.628101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3160  secreted protein  32.35 
 
 		 141 aa  44.3  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>