53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1521 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1521  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  658    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0255  hypothetical protein  33.44 
 
 		 328 aa  183  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0015  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.66 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0015  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.66 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21140  peptidil-prolyl cis-trans isomerase  25.23 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0989  SurA domain protein  23.4 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.47061  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0287  SurA domain protein  23.05 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416052 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0911  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.67 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.159559  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1985  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.75 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0594  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.1 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0016  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  29.27 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000161985  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0887  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.14 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0142655  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1675  hypothetical protein  21.24 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0623436  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2985  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.68 
 
 		 620 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1262  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.29 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0215  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.76 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000367752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0198  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.76 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000154337 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0912  SurA domain protein  25.66 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.557148  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12160  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.24 
 
 		 495 aa  53.5  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000838067  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1512  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.12 
 
 		 355 aa  52.8  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00064667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3548  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.44 
 
 		 323 aa  52.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0874  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  21.43 
 
 		 291 aa  52.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2037  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  25.16 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147855  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3088  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase D)  27.11 
 
 		 628 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000103508  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3230  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase D)  27.11 
 
 		 628 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0103  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.35 
 
 		 632 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.199337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1221  foldase protein PrsA  27 
 
 		 271 aa  49.3  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1690  SurA domain protein  22.15 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0553768 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3049  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase D)  26.51 
 
 		 628 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0375647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0385  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0568  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.6 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000504659  normal  0.286887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5240  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.64 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1637  peptidyl-prolyl cis-trans isomerse D  28.26 
 
 		 628 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2496  hypothetical protein  24.87 
 
 		 571 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0699  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.21 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000032571  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2468  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.83 
 
 		 662 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.038929  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0215  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.39 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.750083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3588  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.99 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000961276  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0141  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.31 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000469336  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0379  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.39 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1820  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D signal peptide protein  28.49 
 
 		 630 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.296428  decreased coverage  0.00152652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2939  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.52 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1715  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase transmembrane protein  27.01 
 
 		 648 aa  43.5  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0289129  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3589  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.46 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000412854  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1079  hypothetical protein  24.33 
 
 		 460 aa  43.1  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.616698  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1836  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.89 
 
 		 617 aa  43.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.900571  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0112  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.9 
 
 		 344 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000942479  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0015  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  23.29 
 
 		 321 aa  43.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0154  putative PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.76 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1098  rotamase family protein  29.1 
 
 		 628 aa  42.7  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1772  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.67 
 
 		 626 aa  42.4  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.546992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1989  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.69 
 
 		 379 aa  42.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0408848  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1000  hypothetical protein  22.52 
 
 		 581 aa  42.7  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00918654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>