24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2496 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2496  hypothetical protein  100 
 
 		 571 aa  1157    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1994  hypothetical protein  38.45 
 
 		 585 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1123  hypothetical protein  37.02 
 
 		 613 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000290136  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3069  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.63 
 
 		 587 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3167  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.95 
 
 		 590 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3262  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.41 
 
 		 587 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1835  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.02 
 
 		 584 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0361  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00808135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0090  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  23.91 
 
 		 307 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1460  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0089  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  24.76 
 
 		 316 aa  53.9  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.322667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3548  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.96 
 
 		 323 aa  53.9  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2432  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.55 
 
 		 299 aa  51.6  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1076  foldase protein PrsA  23.19 
 
 		 275 aa  49.7  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.798492  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0595  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.88 
 
 		 297 aa  48.5  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.880292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0016  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  21.5 
 
 		 313 aa  47.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000161985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0699  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 		 305 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000032571  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1521  hypothetical protein  24.87 
 
 		 328 aa  45.8  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0103  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.97 
 
 		 632 aa  45.8  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.199337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4111  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.77 
 
 		 471 aa  45.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0097  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.06 
 
 		 459 aa  44.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1881  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.59 
 
 		 272 aa  43.9  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1731  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.14 
 
 		 287 aa  43.9  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.68228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0141  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.69 
 
 		 310 aa  43.5  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000469336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>