67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0255 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0255  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  655    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0015  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.73 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0015  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.73 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1521  hypothetical protein  33.54 
 
 		 328 aa  192  9e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21140  peptidil-prolyl cis-trans isomerase  25.23 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1675  hypothetical protein  28.34 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0623436  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0911  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.98 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.159559  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2806  peptidylprolyl isomerase  25.31 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0089  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  24.28 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.322667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0141  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.91 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000469336  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0198  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.18 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000154337 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1690  SurA domain protein  26.97 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0553768 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0594  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.92 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3588  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.86 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000961276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0215  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.07 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000367752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2492  peptidylprolyl isomerase  25.16 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5240  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.28 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0659  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.05 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1512  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.45 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00064667  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0583  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.12 
 
 		 667 aa  54.3  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000501806  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1861  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.23 
 
 		 340 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3548  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.7 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137747  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0351  hypothetical protein  26.23 
 
 		 429 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0376  hypothetical protein  25.89 
 
 		 429 aa  53.1  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1379  hypothetical protein  25.12 
 
 		 536 aa  53.1  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.172229  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0527  hypothetical protein  25.83 
 
 		 629 aa  52.4  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0016  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  24.32 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000161985  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1985  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.14 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0887  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.98 
 
 		 249 aa  50.4  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0142655  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1449  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.33 
 
 		 640 aa  50.4  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.084386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4379  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.56 
 
 		 630 aa  50.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5399  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.66 
 
 		 632 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2468  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.6 
 
 		 662 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.038929  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1989  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.79 
 
 		 379 aa  49.7  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0408848  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0507  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.76 
 
 		 636 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.958122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5572  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.44 
 
 		 632 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3589  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000412854  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3103  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.3 
 
 		 633 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438623  normal  0.777416 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0215  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.54 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.750083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0555  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase D)  25.76 
 
 		 623 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0494  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase D)  25.76 
 
 		 623 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0492  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase D)  25.76 
 
 		 623 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182771  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0511  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase D)  25.76 
 
 		 623 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.362206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0501  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase D)  25.76 
 
 		 623 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0861899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1312  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.72 
 
 		 311 aa  46.6  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0104824  normal  0.0149254 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2149  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.26 
 
 		 636 aa  46.6  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0850396  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4126  peptidylprolyl isomerase  26.75 
 
 		 285 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.174381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0597  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.32 
 
 		 633 aa  46.2  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.261632  normal  0.152752 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3132  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 		 627 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000394697  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1508  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D  21.54 
 
 		 619 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000293924  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2491  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.08 
 
 		 625 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.873203  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1215  peptidylprolyl isomerase  24.75 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1228  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D  24.49 
 
 		 615 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.484685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12160  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.99 
 
 		 495 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000838067  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0823  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D  20.41 
 
 		 618 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0677153  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0090  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  18.18 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0699  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.86 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000032571  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01421  peptidyl-prolyl cis-trans isomerse  24.47 
 
 		 619 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1123  hypothetical protein  25.84 
 
 		 613 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000290136  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1707  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.56 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1735  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.35 
 
 		 635 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.406599  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3234  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.28 
 
 		 629 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2077  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.28 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1243  peptidylprolyl isomerase  23.18 
 
 		 285 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0908  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase D)  27.66 
 
 		 624 aa  42.7  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.44905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2037  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  24.82 
 
 		 329 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147855  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1836  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  18.39 
 
 		 617 aa  42.7  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.900571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>