18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3259 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3259  hypothetical protein  100 
 
 
548 aa  1130    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.592619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5895  hypothetical protein  39.82 
 
 
465 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3257  hypothetical protein  62.03 
 
 
550 aa  91.3  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.728074  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3221  hypothetical protein  33.5 
 
 
516 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2491  hypothetical protein  30.81 
 
 
371 aa  84  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0161  hypothetical protein  32.14 
 
 
292 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0490  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  60.8  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00212165  normal  0.142676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4054  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  60.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4043  hypothetical protein  24.63 
 
 
282 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0108  hypothetical protein  26 
 
 
289 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1202  hypothetical protein  37.08 
 
 
282 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4054  hypothetical protein  24.26 
 
 
289 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0116  hypothetical protein  26.87 
 
 
271 aa  52  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0132  hypothetical protein  26.94 
 
 
271 aa  50.8  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5258  hypothetical protein  24.76 
 
 
282 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03643  hypothetical protein  24.76 
 
 
282 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03694  conserved hypothetical protein  24.76 
 
 
282 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4338  hypothetical protein  24.76 
 
 
282 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>