17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0116 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0116  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  557  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0132  hypothetical protein  98.89 
 
 
271 aa  549  1e-155  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0108  hypothetical protein  41.97 
 
 
289 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4054  hypothetical protein  40.88 
 
 
289 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0161  hypothetical protein  42.96 
 
 
292 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4054  hypothetical protein  41.24 
 
 
292 aa  218  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0490  hypothetical protein  41.24 
 
 
292 aa  217  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00212165  normal  0.142676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1202  hypothetical protein  40.96 
 
 
282 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4043  hypothetical protein  37.63 
 
 
282 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2491  hypothetical protein  38.46 
 
 
371 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5258  hypothetical protein  34.07 
 
 
282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4338  hypothetical protein  33.83 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03694  conserved hypothetical protein  33.7 
 
 
282 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4185  hypothetical protein  33.58 
 
 
282 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996308 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03643  hypothetical protein  33.7 
 
 
282 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5895  hypothetical protein  24.63 
 
 
465 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3259  hypothetical protein  26.87 
 
 
548 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.592619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>