17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0108 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0108  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  601  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4054  hypothetical protein  83.75 
 
 		 289 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4043  hypothetical protein  53.31 
 
 		 282 aa  286  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0161  hypothetical protein  49.11 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1202  hypothetical protein  50.18 
 
 		 282 aa  279  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0490  hypothetical protein  48.24 
 
 		 292 aa  273  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00212165  normal  0.142676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4054  hypothetical protein  48.24 
 
 		 292 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2491  hypothetical protein  49.11 
 
 		 371 aa  269  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0132  hypothetical protein  42.34 
 
 		 271 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0116  hypothetical protein  41.97 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5258  hypothetical protein  33.69 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4338  hypothetical protein  32.97 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03694  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03643  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4185  hypothetical protein  31.27 
 
 		 282 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5895  hypothetical protein  29.06 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3259  hypothetical protein  26 
 
 		 548 aa  59.7  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.592619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>