17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5895 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5895  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  965    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3259  hypothetical protein  39.82 
 
 		 548 aa  235  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.592619  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2491  hypothetical protein  27.36 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0108  hypothetical protein  29.06 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4054  hypothetical protein  36.17 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1202  hypothetical protein  38.1 
 
 		 282 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0490  hypothetical protein  25.95 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00212165  normal  0.142676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4054  hypothetical protein  25.95 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0161  hypothetical protein  34.41 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4043  hypothetical protein  36.08 
 
 		 282 aa  57  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0132  hypothetical protein  24 
 
 		 271 aa  55.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0116  hypothetical protein  24.63 
 
 		 271 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4338  hypothetical protein  36 
 
 		 282 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5258  hypothetical protein  36 
 
 		 282 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03643  hypothetical protein  36 
 
 		 282 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03694  conserved hypothetical protein  36 
 
 		 282 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4185  hypothetical protein  34.67 
 
 		 282 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>