17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1202 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1202  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4043  hypothetical protein  70.67 
 
 
282 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0490  hypothetical protein  66.9 
 
 
292 aa  401  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00212165  normal  0.142676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4054  hypothetical protein  67.24 
 
 
292 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0161  hypothetical protein  66.9 
 
 
292 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4054  hypothetical protein  51.09 
 
 
289 aa  285  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0108  hypothetical protein  50.18 
 
 
289 aa  279  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2491  hypothetical protein  47.79 
 
 
371 aa  258  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0116  hypothetical protein  40.96 
 
 
271 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0132  hypothetical protein  40.59 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5258  hypothetical protein  37.59 
 
 
282 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03694  conserved hypothetical protein  37.23 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03643  hypothetical protein  37.23 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4338  hypothetical protein  36.86 
 
 
282 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4185  hypothetical protein  35.9 
 
 
282 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5895  hypothetical protein  38.1 
 
 
465 aa  59.3  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3259  hypothetical protein  37.08 
 
 
548 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.592619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>