29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2491 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2491  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  775    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4054  hypothetical protein  49.47 
 
 
289 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0108  hypothetical protein  49.11 
 
 
289 aa  269  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4043  hypothetical protein  48.91 
 
 
282 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1202  hypothetical protein  47.79 
 
 
282 aa  258  9e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0161  hypothetical protein  44.41 
 
 
292 aa  255  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4054  hypothetical protein  43.62 
 
 
292 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0490  hypothetical protein  43.62 
 
 
292 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00212165  normal  0.142676 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2991  PAAR domain-containing protein  79.03 
 
 
352 aa  207  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000680915 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2589  hypothetical protein  78.23 
 
 
352 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0797  PAAR domain-containing protein  74.19 
 
 
352 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0116  hypothetical protein  38.46 
 
 
271 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0132  hypothetical protein  38.46 
 
 
271 aa  199  7e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3868  hypothetical protein  71.57 
 
 
512 aa  165  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0748992  normal  0.0167221 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0952  S-type pyocin domain-containing protein  71.57 
 
 
510 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0897  PAAR/S-type pyocin domain-containing protein  71.57 
 
 
510 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5258  hypothetical protein  35.51 
 
 
282 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4338  hypothetical protein  34.64 
 
 
282 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03694  conserved hypothetical protein  35.14 
 
 
282 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03643  hypothetical protein  35.14 
 
 
282 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4185  hypothetical protein  35.29 
 
 
282 aa  159  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996308 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0079  hypothetical protein  35.54 
 
 
470 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3259  hypothetical protein  30.81 
 
 
548 aa  83.6  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.592619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5895  hypothetical protein  27.36 
 
 
465 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  40 
 
 
89 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3920  PAAR repeat-containing protein  38.67 
 
 
92 aa  43.5  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0211  PAAR repeat-containing protein  36 
 
 
93 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5741  PAAR repeat-containing protein  35.14 
 
 
94 aa  42.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0643815  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0990  hypothetical protein  38.16 
 
 
93 aa  42.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>