17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5258 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5258  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03694  conserved hypothetical protein  99.29 
 
 
282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03643  hypothetical protein  99.29 
 
 
282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4338  hypothetical protein  98.58 
 
 
282 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4185  hypothetical protein  84.75 
 
 
282 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996308 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0490  hypothetical protein  39.55 
 
 
292 aa  192  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00212165  normal  0.142676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4054  hypothetical protein  39.55 
 
 
292 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0161  hypothetical protein  38.21 
 
 
292 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1202  hypothetical protein  37.59 
 
 
282 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4043  hypothetical protein  36.59 
 
 
282 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2491  hypothetical protein  35.51 
 
 
371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0108  hypothetical protein  33.69 
 
 
289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4054  hypothetical protein  34.07 
 
 
289 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0116  hypothetical protein  34.07 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0132  hypothetical protein  34.07 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3259  hypothetical protein  24.76 
 
 
548 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.592619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5895  hypothetical protein  36 
 
 
465 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>