15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1303 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1303  putative cation transporter  100 
 
 
350 aa  681    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0604  hypothetical protein  53.5 
 
 
349 aa  341  1e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000679514  hitchhiker  0.0000000100986 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0903  cation transporter  41.64 
 
 
370 aa  275  9e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0665  hypothetical protein  42.78 
 
 
380 aa  273  3e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00659859  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0905  hypothetical protein  43.3 
 
 
369 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1109  protein of unknown function DUF1646  45.86 
 
 
351 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2048  protein of unknown function DUF1646  43.77 
 
 
341 aa  265  8e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000531503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0904  cation transporter  43.87 
 
 
369 aa  264  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58881  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0124  hypothetical protein  42.33 
 
 
372 aa  228  8e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.272093  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2278  cation transporter-like protein  39.63 
 
 
359 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0848  hypothetical protein  34.99 
 
 
351 aa  155  9e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11518  normal  0.339338 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1334  hypothetical protein  35.94 
 
 
351 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1409  hypothetical protein  33.64 
 
 
381 aa  103  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.417974 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1876  hypothetical protein  36.26 
 
 
351 aa  98.6  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0430501  normal  0.425301 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  28.32 
 
 
476 aa  42.7  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>