14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2278 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2278  cation transporter-like protein  100 
 
 
359 aa  686    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1109  protein of unknown function DUF1646  53.04 
 
 
351 aa  362  8e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2048  protein of unknown function DUF1646  44.9 
 
 
341 aa  310  4e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000531503  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0665  hypothetical protein  40.89 
 
 
380 aa  266  5e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00659859  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0903  cation transporter  40.85 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0905  hypothetical protein  39.1 
 
 
369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0904  cation transporter  39.63 
 
 
369 aa  248  9e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58881  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1303  putative cation transporter  38.84 
 
 
350 aa  240  4e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0124  hypothetical protein  42.04 
 
 
372 aa  231  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.272093  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0604  hypothetical protein  38.48 
 
 
349 aa  215  9.999999999999999e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000679514  hitchhiker  0.0000000100986 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0848  hypothetical protein  34.81 
 
 
351 aa  157  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11518  normal  0.339338 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1334  hypothetical protein  36.42 
 
 
351 aa  153  4e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1409  hypothetical protein  31.67 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.417974 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1876  hypothetical protein  31.38 
 
 
351 aa  117  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0430501  normal  0.425301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>