15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0604 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0604  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  690    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000679514  hitchhiker  0.0000000100986 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1303  putative cation transporter  53.16 
 
 
350 aa  353  2e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0665  hypothetical protein  44.32 
 
 
380 aa  286  5e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00659859  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0905  hypothetical protein  41.14 
 
 
369 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0904  cation transporter  42.12 
 
 
369 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58881  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0903  cation transporter  41.13 
 
 
370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1109  protein of unknown function DUF1646  42.18 
 
 
351 aa  246  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2048  protein of unknown function DUF1646  41.52 
 
 
341 aa  235  7e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000531503  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0124  hypothetical protein  42.94 
 
 
372 aa  235  8e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.272093  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2278  cation transporter-like protein  39.2 
 
 
359 aa  202  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1334  hypothetical protein  35.36 
 
 
351 aa  157  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0848  hypothetical protein  32.68 
 
 
351 aa  151  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11518  normal  0.339338 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1409  hypothetical protein  36.11 
 
 
381 aa  95.1  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.417974 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1876  hypothetical protein  35 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0430501  normal  0.425301 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  23.76 
 
 
408 aa  45.8  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>