14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2048 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2048  protein of unknown function DUF1646  100 
 
 
341 aa  661    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000531503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1109  protein of unknown function DUF1646  52.38 
 
 
351 aa  361  1e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0665  hypothetical protein  47.93 
 
 
380 aa  317  1e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00659859  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0904  cation transporter  41.53 
 
 
369 aa  286  4e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58881  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0903  cation transporter  41.27 
 
 
370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2278  cation transporter-like protein  45.45 
 
 
359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0905  hypothetical protein  41.37 
 
 
369 aa  281  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1303  putative cation transporter  42.94 
 
 
350 aa  268  8.999999999999999e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0124  hypothetical protein  40.78 
 
 
372 aa  237  3e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.272093  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0604  hypothetical protein  41.59 
 
 
349 aa  232  7.000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000679514  hitchhiker  0.0000000100986 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0848  hypothetical protein  38.97 
 
 
351 aa  193  3e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11518  normal  0.339338 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1334  hypothetical protein  37.43 
 
 
351 aa  178  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1409  hypothetical protein  32.29 
 
 
381 aa  126  7e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.417974 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1876  hypothetical protein  31.66 
 
 
351 aa  123  5e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0430501  normal  0.425301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>