14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1334 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1334  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  660    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0848  hypothetical protein  71.79 
 
 
351 aa  455  1e-127  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11518  normal  0.339338 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1876  hypothetical protein  73.29 
 
 
351 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0430501  normal  0.425301 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1409  hypothetical protein  72.98 
 
 
381 aa  354  1e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.417974 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2048  protein of unknown function DUF1646  37.91 
 
 
341 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000531503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0904  cation transporter  39.14 
 
 
369 aa  207  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58881  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0905  hypothetical protein  37.88 
 
 
369 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0903  cation transporter  37.88 
 
 
370 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0665  hypothetical protein  37.4 
 
 
380 aa  191  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00659859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1109  protein of unknown function DUF1646  39.31 
 
 
351 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0604  hypothetical protein  35.38 
 
 
349 aa  185  8e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000679514  hitchhiker  0.0000000100986 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1303  putative cation transporter  36.36 
 
 
350 aa  180  4e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2278  cation transporter-like protein  36.17 
 
 
359 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0124  hypothetical protein  34.81 
 
 
372 aa  171  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.272093  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>