14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0903 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0903  cation transporter  100 
 
 
370 aa  722    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0905  hypothetical protein  74.86 
 
 
369 aa  568  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0904  cation transporter  75.68 
 
 
369 aa  553  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58881  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0124  hypothetical protein  58.9 
 
 
372 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.272093  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0665  hypothetical protein  52.97 
 
 
380 aa  362  4e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00659859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1109  protein of unknown function DUF1646  49.72 
 
 
351 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2048  protein of unknown function DUF1646  41.83 
 
 
341 aa  278  9e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000531503  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1303  putative cation transporter  41.64 
 
 
350 aa  275  9e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0604  hypothetical protein  41.4 
 
 
349 aa  268  8e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000679514  hitchhiker  0.0000000100986 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2278  cation transporter-like protein  40.23 
 
 
359 aa  225  8e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0848  hypothetical protein  37.78 
 
 
351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11518  normal  0.339338 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1334  hypothetical protein  38.19 
 
 
351 aa  150  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1409  hypothetical protein  36.23 
 
 
381 aa  117  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.417974 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1876  hypothetical protein  40.64 
 
 
351 aa  113  5e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0430501  normal  0.425301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>