38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0362 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0362  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0456073 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5838  hypothetical protein  25.09 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0753  hypothetical protein  25.93 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.53164  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2893  hypothetical protein  20.97 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2651  hypothetical protein  26.29 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2745  hypothetical protein  24.88 
 
 
282 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.51321  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0499  hypothetical protein  25.24 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.623817  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2554  hypothetical protein  24.76 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.11238  normal  0.887248 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1215  hypothetical protein  25.76 
 
 
284 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00122571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4192  hypothetical protein  28.33 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1456  transglutaminase domain protein  26.77 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1339  hypothetical protein  21.16 
 
 
284 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3003  hypothetical protein  27.78 
 
 
283 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5388  hypothetical protein  25.23 
 
 
245 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.666876  normal  0.357549 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1368  hypothetical protein  23.23 
 
 
272 aa  53.1  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.880811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3568  hypothetical protein  27.31 
 
 
282 aa  52.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.747718 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2526  hypothetical protein  27.46 
 
 
283 aa  52.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.846479  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2475  hypothetical protein  20.59 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1169  hypothetical protein  25.74 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43473  predicted protein  26.67 
 
 
437 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0284  hypothetical protein  17.55 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.964229  normal  0.168748 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3633  hypothetical protein  20.59 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0042  hypothetical protein  25.99 
 
 
294 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00533467  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2998  hypothetical protein  26.63 
 
 
282 aa  49.7  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398739  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2624  hypothetical protein  21.98 
 
 
271 aa  49.3  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000153014  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2425  hypothetical protein  26.63 
 
 
282 aa  48.9  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2558  hypothetical protein  23.23 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14895  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5881  hypothetical protein  24.87 
 
 
280 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.624652  normal  0.456824 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2428  hypothetical protein  23.74 
 
 
281 aa  45.8  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2834  hypothetical protein  23.74 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0875238  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1775  hypothetical protein  24.11 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3024  hypothetical protein  24.38 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1758  hypothetical protein  21.21 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.542914  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02386  tetratricopeptide repeat domain protein  25.37 
 
 
293 aa  43.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3285  hypothetical protein  23.66 
 
 
281 aa  43.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.646924  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2906  hypothetical protein  22.84 
 
 
282 aa  42.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0503  hypothetical protein  20.86 
 
 
274 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.794885  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0087  hypothetical protein  30.43 
 
 
263 aa  42.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.255574  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>