106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0753 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0753  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  541  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.53164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5838  hypothetical protein  58.37 
 
 		 291 aa  331  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2893  hypothetical protein  55.69 
 
 		 282 aa  328  7e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0284  hypothetical protein  43.7 
 
 		 289 aa  244  8e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.964229  normal  0.168748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1954  hypothetical protein  30.91 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1456  transglutaminase domain protein  29.83 
 
 		 283 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1339  hypothetical protein  25.25 
 
 		 284 aa  91.3  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2998  hypothetical protein  29.32 
 
 		 282 aa  90.1  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2425  hypothetical protein  29.32 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1758  hypothetical protein  23.88 
 
 		 280 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.542914  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2475  hypothetical protein  29.88 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2894  hypothetical protein  26.14 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1775  hypothetical protein  28.18 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2767  hypothetical protein  26.67 
 
 		 282 aa  85.9  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0745  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 281 aa  85.9  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3633  hypothetical protein  29.27 
 
 		 265 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2624  hypothetical protein  24.74 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0834  hypothetical protein  31.25 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0499  hypothetical protein  28.74 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.623817  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0533  hypothetical protein  26.73 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2526  hypothetical protein  27.65 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.846479  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1169  hypothetical protein  27.62 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3201  hypothetical protein  25.6 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0130133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0761  hypothetical protein  25.6 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2183  hypothetical protein  26.52 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2558  hypothetical protein  26.92 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2906  hypothetical protein  26.47 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0503  hypothetical protein  27.07 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.794885  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2834  hypothetical protein  26.47 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0875238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5388  hypothetical protein  26.78 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.666876  normal  0.357549 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2428  hypothetical protein  26.47 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3285  hypothetical protein  28.57 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.646924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3568  hypothetical protein  26.52 
 
 		 282 aa  78.6  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.747718 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0042  hypothetical protein  29.75 
 
 		 294 aa  78.6  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00533467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1473  hypothetical protein  24.73 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.797183 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3003  hypothetical protein  26.52 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4192  hypothetical protein  30 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269295 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02386  tetratricopeptide repeat domain protein  27.59 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3024  hypothetical protein  23.76 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0362  hypothetical protein  25.93 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0456073 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5881  hypothetical protein  24.51 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.624652  normal  0.456824 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1937  hypothetical protein  27.39 
 
 		 280 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2549  hypothetical protein  27.39 
 
 		 280 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.934561  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2573  hypothetical protein  27.39 
 
 		 280 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590374 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0671  hypothetical protein  26.06 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0747  hypothetical protein  27.27 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.583133  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2598  hypothetical protein  27.56 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2468  hypothetical protein  27.45 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867567 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2745  hypothetical protein  23.53 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.51321  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0737  hypothetical protein  22.93 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2651  hypothetical protein  24.86 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702443  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1078  hypothetical protein  23.53 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107032  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0922  hypothetical protein  23.53 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.425881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0925  hypothetical protein  23.53 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0679  transcriptional regulator  23.53 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2514  hypothetical protein  23.53 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0128  hypothetical protein  23.53 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_6509  predicted protein  21.43 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.236184  normal  0.418162 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1215  hypothetical protein  24.75 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00122571  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3588  hypothetical protein  26.62 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2554  hypothetical protein  23.61 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.11238  normal  0.887248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0176  hypothetical protein  20 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.244166 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1164  hypothetical protein  23.18 
 
 		 268 aa  62  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2055  hypothetical protein  23.68 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0087  hypothetical protein  24.54 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.255574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3860  hypothetical protein  26.21 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493821  normal  0.355777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2075  putative transcriptional regulator  24.21 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01189  predicted transcriptional regulator  25 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.506875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2433  sirB1 protein  25 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00804318  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1319  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000562395  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1362  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00721974  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2412  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.402469  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1928  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0634354  normal  0.0610741 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1378  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0629002  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1695  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0244126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01199  hypothetical protein  25 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498926  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004200  protein SirB1  34.94 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10750  hypothetical protein  28.44 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4618  hypothetical protein  26.02 
 
 		 268 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4478  hypothetical protein  26.02 
 
 		 268 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.242324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0869  putative transcritional regulator  23.13 
 
 		 338 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202416  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1368  hypothetical protein  23.12 
 
 		 272 aa  53.1  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.880811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3249  hypothetical protein  24.56 
 
 		 267 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1858  putative transcriptional regulator  24.06 
 
 		 269 aa  52.4  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.155221  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01253  hypothetical protein  32.22 
 
 		 269 aa  52.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0947  hypothetical protein  29.49 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0793  protein SirB1  30.77 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.293934  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1707  hypothetical protein  28.3 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1610  hypothetical protein  29.49 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119985  normal  0.579551 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1753  hypothetical protein  25.32 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000302338  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2404  putative transcriptional regulator  30.7 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43473  predicted protein  20.81 
 
 		 437 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2111  putative transcriptional regulator  30.7 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19860  hypothetical protein  29.25 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1191  hypothetical protein  24.17 
 
 		 267 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1993  putative transcriptional regulator  23.66 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.236117  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1027  hypothetical protein  26.87 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2063  putative transcriptional regulator  22.56 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000599802  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2457  putative transcriptional regulator  22.56 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2176  putative transcriptional regulator  22.56 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.064164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>