27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0060 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0060  DNA-damage-inducible protein D  100 
 
 		 274 aa  569  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4096  DNA-damage-inducible protein D  84.31 
 
 		 274 aa  474  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3980  DNA-damage-inducible protein D  84.31 
 
 		 274 aa  475  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0985266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4147  DNA-damage-inducible protein D  83.94 
 
 		 274 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920819  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0066  DNA-damage-inducible protein D  84.31 
 
 		 274 aa  455  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.219012  hitchhiker  0.000013205 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03454  hypothetical protein  84.31 
 
 		 274 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03502  DNA-damage-inducible protein  84.31 
 
 		 278 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.516594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5016  DNA-damage-inducible protein D  84.31 
 
 		 274 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.760617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0973  DNA-damage-inducible protein D  69 
 
 		 362 aa  403  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.965716  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0943  DNA-damage-inducible protein D  68.01 
 
 		 281 aa  390  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0021495  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4089  DNA-damage-inducible protein D  55.89 
 
 		 285 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0033  DNA-damage-inducible protein D  50.38 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1524  DNA-damage-inducible protein D  35.16 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1711  DNA-damage-inducible protein D  38.37 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0133  DNA-damage-inducible protein D  37.45 
 
 		 281 aa  152  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277951 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4242  DNA-damage-inducible protein D  36.02 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0196  DNA-damage-inducible protein D  34.11 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0959  DNA-damage-inducible protein D  35.04 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1486  DNA-damage-inducible protein  34.62 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2468  DNA-damage-inducible protein D  35.66 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0074  DNA-damage-inducible protein D  52.25 
 
 		 123 aa  135  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.155764 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  56.48 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1522  hypothetical protein  39.33 
 
 		 187 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0916  DNA-damage-inducible protein D  29.46 
 
 		 241 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0766  DNA-damage-inducible protein  37.29 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0312128  normal  0.422961 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1124  hypothetical protein  32.74 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0327525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0161  hypothetical protein  44.62 
 
 		 92 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>