21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1124 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1124  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  385  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0327525  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1486  DNA-damage-inducible protein  35.76 
 
 		 269 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0943  DNA-damage-inducible protein D  31.61 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0021495  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0033  DNA-damage-inducible protein D  36.67 
 
 		 295 aa  82  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0973  DNA-damage-inducible protein D  28.95 
 
 		 362 aa  77.8  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.965716  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4096  DNA-damage-inducible protein D  32.14 
 
 		 274 aa  77.8  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3980  DNA-damage-inducible protein D  33.33 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0985266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4147  DNA-damage-inducible protein D  33.33 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920819  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0060  DNA-damage-inducible protein D  32.74 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4089  DNA-damage-inducible protein D  29.14 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03502  DNA-damage-inducible protein  32.14 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.516594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0066  DNA-damage-inducible protein D  32.14 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.219012  hitchhiker  0.000013205 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03454  hypothetical protein  32.14 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5016  DNA-damage-inducible protein D  32.03 
 
 		 274 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.760617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0959  DNA-damage-inducible protein D  31.58 
 
 		 287 aa  50.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0196  DNA-damage-inducible protein D  31.11 
 
 		 288 aa  48.5  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2468  DNA-damage-inducible protein D  25.64 
 
 		 284 aa  48.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1524  DNA-damage-inducible protein D  27.62 
 
 		 287 aa  48.1  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0133  DNA-damage-inducible protein D  28.08 
 
 		 281 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277951 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1711  DNA-damage-inducible protein D  26.36 
 
 		 284 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4242  DNA-damage-inducible protein D  28.21 
 
 		 289 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>