26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1486 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1486  DNA-damage-inducible protein  100 
 
 		 269 aa  551  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0943  DNA-damage-inducible protein D  34.97 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0021495  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4089  DNA-damage-inducible protein D  35.61 
 
 		 285 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0060  DNA-damage-inducible protein D  34.62 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0973  DNA-damage-inducible protein D  34.36 
 
 		 362 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.965716  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3980  DNA-damage-inducible protein D  33.98 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0985266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4147  DNA-damage-inducible protein D  33.98 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920819  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4096  DNA-damage-inducible protein D  34.23 
 
 		 274 aa  135  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5016  DNA-damage-inducible protein D  33.85 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.760617  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03502  DNA-damage-inducible protein  33.59 
 
 		 278 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.516594  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03454  hypothetical protein  33.59 
 
 		 274 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0066  DNA-damage-inducible protein D  33.59 
 
 		 274 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.219012  hitchhiker  0.000013205 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0033  DNA-damage-inducible protein D  32.66 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1124  hypothetical protein  35.76 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0327525  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0959  DNA-damage-inducible protein D  29.66 
 
 		 287 aa  99  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0133  DNA-damage-inducible protein D  27.24 
 
 		 281 aa  98.6  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277951 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2468  DNA-damage-inducible protein D  29.53 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1524  DNA-damage-inducible protein D  26.52 
 
 		 287 aa  95.9  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1711  DNA-damage-inducible protein D  28.08 
 
 		 284 aa  95.5  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0196  DNA-damage-inducible protein D  27.01 
 
 		 288 aa  92.4  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4242  DNA-damage-inducible protein D  25.48 
 
 		 289 aa  89.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1522  hypothetical protein  35.2 
 
 		 187 aa  74.7  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  36.36 
 
 		 412 aa  68.6  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0916  DNA-damage-inducible protein D  32.97 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0766  DNA-damage-inducible protein  30.77 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0312128  normal  0.422961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0074  DNA-damage-inducible protein D  34.07 
 
 		 123 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.155764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>