27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0959 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0959  DNA-damage-inducible protein D  100 
 
 		 287 aa  599  1e-170  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1524  DNA-damage-inducible protein D  65.61 
 
 		 287 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0196  DNA-damage-inducible protein D  65.26 
 
 		 288 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4242  DNA-damage-inducible protein D  64.21 
 
 		 289 aa  381  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0133  DNA-damage-inducible protein D  53.61 
 
 		 281 aa  278  8e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277951 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1711  DNA-damage-inducible protein D  52.63 
 
 		 284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2468  DNA-damage-inducible protein D  49.8 
 
 		 284 aa  259  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0916  DNA-damage-inducible protein D  41.3 
 
 		 241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1522  hypothetical protein  54.61 
 
 		 187 aa  170  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4089  DNA-damage-inducible protein D  33.46 
 
 		 285 aa  155  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4096  DNA-damage-inducible protein D  36.53 
 
 		 274 aa  152  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3980  DNA-damage-inducible protein D  36.16 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0985266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4147  DNA-damage-inducible protein D  36.16 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920819  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03454  hypothetical protein  36.16 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03502  DNA-damage-inducible protein  36.16 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.516594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0066  DNA-damage-inducible protein D  36.16 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.219012  hitchhiker  0.000013205 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0973  DNA-damage-inducible protein D  33.7 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.965716  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0060  DNA-damage-inducible protein D  35.04 
 
 		 274 aa  145  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5016  DNA-damage-inducible protein D  35.06 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.760617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0943  DNA-damage-inducible protein D  31.52 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0021495  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0033  DNA-damage-inducible protein D  36.21 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0074  DNA-damage-inducible protein D  46.81 
 
 		 123 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.155764 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1486  DNA-damage-inducible protein  29.66 
 
 		 269 aa  99  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0766  DNA-damage-inducible protein  33.99 
 
 		 215 aa  85.9  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0312128  normal  0.422961 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  40.66 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0161  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1124  hypothetical protein  31.58 
 
 		 186 aa  50.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0327525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>