28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1711 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1711  DNA-damage-inducible protein D  100 
 
 		 284 aa  587  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2468  DNA-damage-inducible protein D  91.55 
 
 		 284 aa  542  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0133  DNA-damage-inducible protein D  80.71 
 
 		 281 aa  483  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277951 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0916  DNA-damage-inducible protein D  75.35 
 
 		 241 aa  430  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1524  DNA-damage-inducible protein D  48.91 
 
 		 287 aa  280  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0959  DNA-damage-inducible protein D  52.63 
 
 		 287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4242  DNA-damage-inducible protein D  48.73 
 
 		 289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0196  DNA-damage-inducible protein D  47.7 
 
 		 288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0033  DNA-damage-inducible protein D  40.65 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0060  DNA-damage-inducible protein D  38.37 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0973  DNA-damage-inducible protein D  37.55 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.965716  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3980  DNA-damage-inducible protein D  38.37 
 
 		 274 aa  152  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0985266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4096  DNA-damage-inducible protein D  38.37 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5016  DNA-damage-inducible protein D  38.13 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.760617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4147  DNA-damage-inducible protein D  38.37 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920819  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03454  hypothetical protein  38.52 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1522  hypothetical protein  52.42 
 
 		 187 aa  150  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0066  DNA-damage-inducible protein D  38.52 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.219012  hitchhiker  0.000013205 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03502  DNA-damage-inducible protein  38.52 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.516594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4089  DNA-damage-inducible protein D  34.55 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0943  DNA-damage-inducible protein D  33.22 
 
 		 281 aa  127  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0021495  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0074  DNA-damage-inducible protein D  47.71 
 
 		 123 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.155764 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  44.35 
 
 		 412 aa  104  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1486  DNA-damage-inducible protein  28.08 
 
 		 269 aa  95.5  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0766  DNA-damage-inducible protein  36.43 
 
 		 215 aa  88.6  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0312128  normal  0.422961 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4169  hypothetical protein  59.62 
 
 		 67 aa  78.2  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0161  hypothetical protein  44.93 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1124  hypothetical protein  26.36 
 
 		 186 aa  46.6  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0327525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>