27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0916 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0916  DNA-damage-inducible protein D  100 
 
 		 241 aa  503  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2468  DNA-damage-inducible protein D  78.17 
 
 		 284 aa  442  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1711  DNA-damage-inducible protein D  75.35 
 
 		 284 aa  430  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0133  DNA-damage-inducible protein D  62.23 
 
 		 281 aa  357  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277951 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1524  DNA-damage-inducible protein D  41.84 
 
 		 287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0196  DNA-damage-inducible protein D  39.58 
 
 		 288 aa  205  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4242  DNA-damage-inducible protein D  40 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0959  DNA-damage-inducible protein D  41.3 
 
 		 287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0033  DNA-damage-inducible protein D  34.41 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1522  hypothetical protein  44.14 
 
 		 187 aa  109  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0060  DNA-damage-inducible protein D  29.46 
 
 		 274 aa  105  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4089  DNA-damage-inducible protein D  49.5 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0973  DNA-damage-inducible protein D  29 
 
 		 362 aa  101  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.965716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0074  DNA-damage-inducible protein D  44 
 
 		 123 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.155764 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3980  DNA-damage-inducible protein D  29.07 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0985266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4096  DNA-damage-inducible protein D  29.07 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03454  hypothetical protein  29.07 
 
 		 274 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03502  DNA-damage-inducible protein  29.07 
 
 		 278 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.516594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0066  DNA-damage-inducible protein D  29.07 
 
 		 274 aa  99  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.219012  hitchhiker  0.000013205 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4147  DNA-damage-inducible protein D  29.07 
 
 		 274 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920819  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5016  DNA-damage-inducible protein D  29.46 
 
 		 274 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.760617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0943  DNA-damage-inducible protein D  29.08 
 
 		 281 aa  95.1  8e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0021495  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  40.87 
 
 		 412 aa  93.2  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4169  hypothetical protein  59.62 
 
 		 67 aa  78.2  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0766  DNA-damage-inducible protein  36.89 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0312128  normal  0.422961 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1486  DNA-damage-inducible protein  32.97 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0161  hypothetical protein  39.47 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>