25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0161 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0161  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0033  DNA-damage-inducible protein D  70.15 
 
 		 295 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4089  DNA-damage-inducible protein D  43.04 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0133  DNA-damage-inducible protein D  47.83 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277951 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1711  DNA-damage-inducible protein D  44.93 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0074  DNA-damage-inducible protein D  37.88 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.155764 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5016  DNA-damage-inducible protein D  42.42 
 
 		 274 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.760617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0973  DNA-damage-inducible protein D  37.04 
 
 		 362 aa  63.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.965716  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4096  DNA-damage-inducible protein D  41.18 
 
 		 274 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3980  DNA-damage-inducible protein D  41.18 
 
 		 274 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0985266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4147  DNA-damage-inducible protein D  41.18 
 
 		 274 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920819  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0060  DNA-damage-inducible protein D  44.62 
 
 		 274 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03454  hypothetical protein  42.42 
 
 		 274 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0066  DNA-damage-inducible protein D  42.42 
 
 		 274 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.219012  hitchhiker  0.000013205 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03502  DNA-damage-inducible protein  42.42 
 
 		 278 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.516594  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0196  DNA-damage-inducible protein D  40.24 
 
 		 288 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4242  DNA-damage-inducible protein D  41.94 
 
 		 289 aa  60.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2468  DNA-damage-inducible protein D  39.47 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0916  DNA-damage-inducible protein D  39.47 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0959  DNA-damage-inducible protein D  50 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1524  DNA-damage-inducible protein D  45 
 
 		 287 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0943  DNA-damage-inducible protein D  32.89 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0021495  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1522  hypothetical protein  40.74 
 
 		 187 aa  51.6  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  36.07 
 
 		 412 aa  48.9  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0766  DNA-damage-inducible protein  31.58 
 
 		 215 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0312128  normal  0.422961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>