28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0033 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0033  DNA-damage-inducible protein D  100 
 
 		 295 aa  607  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4096  DNA-damage-inducible protein D  50.38 
 
 		 274 aa  258  8e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4147  DNA-damage-inducible protein D  49.62 
 
 		 274 aa  253  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920819  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3980  DNA-damage-inducible protein D  49.62 
 
 		 274 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0985266  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0060  DNA-damage-inducible protein D  50.38 
 
 		 274 aa  246  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0066  DNA-damage-inducible protein D  49.62 
 
 		 274 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.219012  hitchhiker  0.000013205 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03454  hypothetical protein  49.62 
 
 		 274 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03502  DNA-damage-inducible protein  49.62 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.516594  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0973  DNA-damage-inducible protein D  45.72 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.965716  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5016  DNA-damage-inducible protein D  48.85 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.760617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0943  DNA-damage-inducible protein D  45.45 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0021495  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4089  DNA-damage-inducible protein D  43.27 
 
 		 285 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4242  DNA-damage-inducible protein D  38.63 
 
 		 289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0196  DNA-damage-inducible protein D  39.02 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1711  DNA-damage-inducible protein D  40.65 
 
 		 284 aa  170  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1524  DNA-damage-inducible protein D  37.85 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2468  DNA-damage-inducible protein D  39.43 
 
 		 284 aa  162  7e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0133  DNA-damage-inducible protein D  37.21 
 
 		 281 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277951 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0959  DNA-damage-inducible protein D  36.21 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1486  DNA-damage-inducible protein  32.26 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1522  hypothetical protein  42.47 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0916  DNA-damage-inducible protein D  34.82 
 
 		 241 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0161  hypothetical protein  70.15 
 
 		 92 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0074  DNA-damage-inducible protein D  40.16 
 
 		 123 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.155764 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1124  hypothetical protein  34.46 
 
 		 186 aa  93.2  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0327525  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0766  DNA-damage-inducible protein  41.38 
 
 		 215 aa  93.6  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0312128  normal  0.422961 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  42.72 
 
 		 412 aa  90.5  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4169  hypothetical protein  51.35 
 
 		 67 aa  43.1  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>