39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2593 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2593  lactoylglutathione lyase  100 
 
 		 131 aa  268  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116065 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2225  methylmalonyl-CoA epimerase  35.94 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0281  hypothetical protein  24.81 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.189275  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0552  methylmalonyl-CoA epimerase  34.45 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3193  hypothetical protein  26.15 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  29.46 
 
 		 7122 aa  53.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1372  methylmalonyl-CoA epimerase  28.15 
 
 		 139 aa  50.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0208267 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0812  methylmalonyl-CoA epimerase  25.21 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2934  methylmalonyl-CoA epimerase  24.37 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0637  methylmalonyl-CoA epimerase  25.21 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1198  methylmalonyl-CoA epimerase  22.69 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2469  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.21 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1003  methylmalonyl-CoA epimerase  22.69 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862504  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1069  methylmalonyl-CoA epimerase  22.69 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17549  normal  0.247158 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0092  hypothetical protein  26.09 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2814  methylmalonyl-CoA epimerase  29.17 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744827  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4617  methylmalonyl-CoA epimerase  22.69 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2630  putative glyoxalase  25.21 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0581567 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0368  methylmalonyl-CoA epimerase  25.21 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.528801  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03285  Lactoylglutathione lyase and related lyase  27.97 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275732  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2348  methylmalonyl-CoA epimerase  21.8 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  26.27 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1564  methylmalonyl-CoA epimerase  26.27 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.395959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2892  methylmalonyl-CoA epimerase  27.64 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.20735 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1038  methylmalonyl-CoA epimerase  25.83 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00716429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1341  methylmalonyl-CoA epimerase  24.62 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.886384  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_004310  BR0818  glyoxalase family protein  25.83 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688033  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3164  methylmalonyl-CoA epimerase  23.53 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2043  methylmalonyl-CoA epimerase  21.85 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1316  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0813  methylmalonyl-CoA epimerase  25.83 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  33.33 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4142  methylmalonyl-CoA epimerase  24.17 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65243  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1572  methylmalonyl-CoA epimerase  22.69 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0422  hypothetical protein  26.32 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  33.33 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  33.33 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2407  methylmalonyl-CoA epimerase  25 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914364  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  24.19 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>