36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0281 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0281  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  294  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.189275  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  30.88 
 
 		 7122 aa  87.8  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1635  lactoylglutathione lyase  31.58 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0641536  normal  0.0230856 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2225  methylmalonyl-CoA epimerase  30.53 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2593  lactoylglutathione lyase  24.81 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2364  methylmalonyl-CoA epimerase  28.28 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2198  methylmalonyl-CoA epimerase  33.91 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0422  hypothetical protein  27.86 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3193  hypothetical protein  26.36 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2892  methylmalonyl-CoA epimerase  26.28 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.20735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5865  methylmalonyl-CoA epimerase  30.1 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0384  methylmalonyl-CoA epimerase  34.62 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0368  methylmalonyl-CoA epimerase  29.37 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.528801  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2814  methylmalonyl-CoA epimerase  24.09 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744827  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.36 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.36 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1341  methylmalonyl-CoA epimerase  22.73 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.886384  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1003  methylmalonyl-CoA epimerase  27.78 
 
 		 134 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862504  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2630  putative glyoxalase  28.57 
 
 		 134 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0581567 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3164  methylmalonyl-CoA epimerase  30.77 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2204  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.47 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269576  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0818  glyoxalase family protein  30.08 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688033  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1198  methylmalonyl-CoA epimerase  26.98 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2348  methylmalonyl-CoA epimerase  24.81 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1069  methylmalonyl-CoA epimerase  26.98 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17549  normal  0.247158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0812  methylmalonyl-CoA epimerase  28.57 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2469  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2043  methylmalonyl-CoA epimerase  26.19 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.23 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0637  methylmalonyl-CoA epimerase  28.15 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0813  methylmalonyl-CoA epimerase  30.08 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5823  methylmalonyl-CoA epimerase  28.36 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0552  methylmalonyl-CoA epimerase  20.56 
 
 		 134 aa  40  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1733  lactoylglutathione lyase  34.57 
 
 		 134 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2178  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.8 
 
 		 134 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.794327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  21.37 
 
 		 129 aa  40  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>