73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3262 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3262  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 70 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.941421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3714  putative transcriptional regulator, XRE family  51.47 
 
 		 70 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0636  transcriptional regulator, XRE family  47.76 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0844  putative transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 68 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1655  hypothetical protein  47.06 
 
 		 68 aa  72  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1528  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000508526  hitchhiker  0.00000000279301 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1000  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000480499 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1546  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 73 aa  67.4  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00936975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3293  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2865  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 67 aa  67  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000773901  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0656  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1909  putative transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386637 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1421  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0370  hypothetical protein  41.27 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225094  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2154  putative transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440989  hitchhiker  0.00829248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2426  putative transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0705  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.45038  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1465  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1108  hypothetical protein  31.88 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.594849  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1464  hypothetical protein  32.86 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0330  hypothetical protein  36.92 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0997  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1539  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0419417 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1695  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0597679  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71330  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6190  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876157  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3417  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2806  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5711  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4482  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111215  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1830  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1981  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.287792  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2733  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4332  helix-turn-helix type 3  30.43 
 
 		 77 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1440  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1037  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2358  hypothetical protein  30.43 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081812  decreased coverage  0.0000157362 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1666  aspartate/glutamate/uridylate kinase-like protein  28.81 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.962131  hitchhiker  0.00000000000435388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5346  putative transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413727 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1800  Cro/CI family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0218  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  30.56 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4481  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1216  putative HTH-type transcriptional regulator  30.43 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3173  putative transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2183  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 71 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0484  XRE family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 77 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2194  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 72 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135264  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11560  predicted transcriptional regulator  28.33 
 
 		 70 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5760  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205139  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0478  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3882  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2209  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  31.67 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0788  transcriptional regulator, Cro/CI family  32.2 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0314  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203005  normal  0.441895 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1982  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.995083  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0490  hypothetical protein  32.69 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0418  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007588  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0466  hypothetical protein  32.69 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3957  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010777  normal  0.26793 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3255  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2262  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.914675  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3550  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2707  transcriptional regulator, XRE family  28.33 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4871  DNA-binding protein  28.81 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1336  hypothetical protein  32.84 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.94784  normal  0.842689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0100  transcriptional regulator, XRE family  28.33 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4366  transcriptional regulator  28.81 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0270567  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4519  DNA-binding protein  28.81 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3657  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.544629  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0169  Cro/CI family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0106537  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3642  XRE family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182949  normal  0.278552 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1951  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0335085 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4238  transcriptional regulator, XRE family  28.99 
 
 		 69 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>