21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1464 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1464  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  193  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3293  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1000  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000480499 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1655  hypothetical protein  43.28 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1546  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00936975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3714  putative transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0636  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3262  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.941421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0844  putative transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0370  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225094  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2865  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000773901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2426  putative transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0705  transcriptional regulator  30 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.45038  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1465  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1528  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000508526  hitchhiker  0.00000000279301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0251  transcriptional regulator, XRE family  27.87 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0330  hypothetical protein  33.87 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2154  putative transcriptional regulator, XRE family  26.39 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440989  hitchhiker  0.00829248 
 
 
-
 
NC_002936  DET1108  hypothetical protein  32.84 
 
 		 74 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.594849  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4458  putative transcriptional regulator, XRE family  28.79 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0066  transcriptional regulator, XRE family  29.23 
 
 		 262 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>