34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3714 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3714  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 70 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0844  putative transcriptional regulator, XRE family  57.58 
 
 		 68 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3262  transcriptional regulator, XRE family  51.47 
 
 		 70 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.941421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1546  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 		 73 aa  60.5  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00936975  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0370  hypothetical protein  45.9 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225094  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1655  hypothetical protein  44.62 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1909  putative transcriptional regulator, XRE family  48.94 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386637 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2865  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000773901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2426  putative transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2154  putative transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440989  hitchhiker  0.00829248 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1528  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 67 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000508526  hitchhiker  0.00000000279301 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1464  hypothetical protein  32.35 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3293  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0705  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.45038  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1465  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 82 aa  48.9  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0636  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3417  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1000  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000480499 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1800  Cro/CI family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5760  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205139  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_002936  DET1108  hypothetical protein  34.85 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.594849  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2650  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213866  normal  0.098962 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4458  putative transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1695  transcriptional regulator  42.55 
 
 		 70 aa  42  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0597679  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2988  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 74 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.962229 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1951  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0335085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0314  XRE family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203005  normal  0.441895 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3882  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6190  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71330  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2718  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1421  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3642  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 82 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182949  normal  0.278552 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4482  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 82 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111215  normal  0.686525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>