60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0848 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0848  protein of unknown function DUF952  100 
 
 		 111 aa  221  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0194191  normal  0.118784 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1549  hypothetical protein  72.07 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0531492  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3013  hypothetical protein  63.64 
 
 		 112 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  0.256865 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2962  hypothetical protein  69.72 
 
 		 111 aa  133  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2616  hypothetical protein  62.73 
 
 		 112 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0956  hypothetical protein  62.73 
 
 		 112 aa  133  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3257  hypothetical protein  64.86 
 
 		 115 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2883  hypothetical protein  61.54 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646253  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4536  protein of unknown function DUF952  63.06 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359065  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0162  hypothetical protein  59.26 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal  0.834789 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0405  hypothetical protein  61.26 
 
 		 116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2059  protein of unknown function DUF952  60.19 
 
 		 116 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0548  hypothetical protein  59.26 
 
 		 116 aa  114  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303281  normal  0.0576469 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1468  hypothetical protein  58.72 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0585  hypothetical protein  57.66 
 
 		 143 aa  113  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0093  hypothetical protein  54.63 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0326  hypothetical protein  58.72 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2383  protein of unknown function DUF952  55.56 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0312  hypothetical protein  58.72 
 
 		 117 aa  110  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2897  hypothetical protein  59.79 
 
 		 115 aa  110  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.359855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2107  hypothetical protein  54.63 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.808396  normal  0.0238058 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0436  hypothetical protein  55.56 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0221  protein of unknown function DUF952  54.63 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.808162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0192  protein of unknown function DUF952  52.78 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0756  hypothetical protein  53.7 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824326  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0864  protein of unknown function DUF952  52.68 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781943  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4623  hypothetical protein  52.29 
 
 		 114 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1917  hypothetical protein  58.14 
 
 		 117 aa  100  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0606069  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0387  hypothetical protein  54.08 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.580664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0787  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732307 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1067  hypothetical protein  46.73 
 
 		 117 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0465  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0556  hypothetical protein  49.09 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0792  hypothetical protein  48.15 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855972 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1163  hypothetical protein  48.81 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0556708  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3797  protein of unknown function DUF952  49.53 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.899474 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0517  hypothetical protein  52.94 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0513  hypothetical protein  44.29 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11264  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0861  hypothetical protein  43.42 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1916  hypothetical protein  32.93 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5199  protein of unknown function DUF952  33.7 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3868  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2860  hypothetical protein  28.16 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000466115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2571  hypothetical protein  26.85 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000205599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2813  hypothetical protein  25.93 
 
 		 110 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0272117  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2182  hypothetical protein  39.76 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0952783  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2228  hypothetical protein  39.76 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2622  hypothetical protein  25.93 
 
 		 112 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0382701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2820  hypothetical protein  25.93 
 
 		 110 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000165343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2171  hypothetical protein  39.76 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0419076  hitchhiker  0.00150651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1066  protein of unknown function DUF952  32.31 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.210696 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2838  hypothetical protein  25.93 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000244787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2472  hypothetical protein  27.18 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0467967  normal  0.531693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2456  hypothetical protein  41.38 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2563  protein of unknown function DUF952  27.66 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2614  hypothetical protein  28.75 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0019859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2538  hypothetical protein  25.93 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.070285  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12720  hypothetical protein  41.38 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3672  hypothetical protein  37.29 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3543  protein of unknown function DUF952  26.6 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>