62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1549 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1549  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  228  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0531492  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0848  protein of unknown function DUF952  72.73 
 
 		 111 aa  164  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0194191  normal  0.118784 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3013  hypothetical protein  63.06 
 
 		 112 aa  141  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  0.256865 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2616  hypothetical protein  63.06 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0956  hypothetical protein  63.06 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4536  protein of unknown function DUF952  62.16 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359065  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2962  hypothetical protein  62.16 
 
 		 111 aa  127  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2883  hypothetical protein  58.1 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646253  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0585  hypothetical protein  58.18 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3257  hypothetical protein  59.46 
 
 		 115 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0405  hypothetical protein  58.72 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0436  hypothetical protein  59.63 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1468  hypothetical protein  59.63 
 
 		 120 aa  120  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2383  protein of unknown function DUF952  56.76 
 
 		 116 aa  120  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2059  protein of unknown function DUF952  56.25 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0093  hypothetical protein  58.33 
 
 		 115 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0548  hypothetical protein  55.36 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303281  normal  0.0576469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2107  hypothetical protein  55.86 
 
 		 116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.808396  normal  0.0238058 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0162  hypothetical protein  55.56 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal  0.834789 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0326  hypothetical protein  55.96 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0312  hypothetical protein  55.96 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2897  hypothetical protein  58.76 
 
 		 115 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.359855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0221  protein of unknown function DUF952  51.85 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.808162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0756  hypothetical protein  51.85 
 
 		 114 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824326  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0192  protein of unknown function DUF952  50.93 
 
 		 117 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1067  hypothetical protein  49.53 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0864  protein of unknown function DUF952  50 
 
 		 114 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781943  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1917  hypothetical protein  47.71 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0606069  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3797  protein of unknown function DUF952  51.4 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.899474 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0465  hypothetical protein  48.15 
 
 		 114 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0387  hypothetical protein  53.06 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.580664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0556  hypothetical protein  47.32 
 
 		 131 aa  94  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4623  hypothetical protein  47.22 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0787  hypothetical protein  45.37 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0792  hypothetical protein  46.3 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855972 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1163  hypothetical protein  45.56 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0556708  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0517  hypothetical protein  41.38 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0513  hypothetical protein  39.58 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11264  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0861  hypothetical protein  41.33 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2860  hypothetical protein  27.55 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000466115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2571  hypothetical protein  25.69 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000205599  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1916  hypothetical protein  27.27 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2622  hypothetical protein  24.77 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0382701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2813  hypothetical protein  25 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0272117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2838  hypothetical protein  25 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000244787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2820  hypothetical protein  25 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000165343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2456  hypothetical protein  31.25 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3868  hypothetical protein  30.7 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2472  hypothetical protein  25.77 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0467967  normal  0.531693 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2538  hypothetical protein  23.85 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.070285  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5199  protein of unknown function DUF952  32.18 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2614  hypothetical protein  24.07 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0019859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2228  hypothetical protein  36.71 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2563  protein of unknown function DUF952  24.24 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2171  hypothetical protein  36.71 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0419076  hitchhiker  0.00150651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2182  hypothetical protein  36.71 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0952783  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1066  protein of unknown function DUF952  26.42 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.210696 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3672  hypothetical protein  28.83 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3543  protein of unknown function DUF952  23.23 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3943  hypothetical protein  32.56 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1680  protein of unknown function DUF952  34.62 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569653  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1633  protein of unknown function DUF952  29.67 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0372909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>