52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2883 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2883  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  246  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646253  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2616  hypothetical protein  62.86 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0956  hypothetical protein  61.9 
 
 		 112 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3013  hypothetical protein  60.95 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  0.256865 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0848  protein of unknown function DUF952  61.54 
 
 		 111 aa  124  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0194191  normal  0.118784 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1549  hypothetical protein  58.1 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0531492  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2897  hypothetical protein  57.61 
 
 		 115 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.359855 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0162  hypothetical protein  52.73 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal  0.834789 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2962  hypothetical protein  55.24 
 
 		 111 aa  100  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0756  hypothetical protein  49.09 
 
 		 114 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824326  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0864  protein of unknown function DUF952  48.57 
 
 		 114 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781943  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4623  hypothetical protein  48.18 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0093  hypothetical protein  47.22 
 
 		 115 aa  97.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4536  protein of unknown function DUF952  55.34 
 
 		 115 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359065  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1468  hypothetical protein  50.45 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2383  protein of unknown function DUF952  51.46 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3257  hypothetical protein  54.37 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2059  protein of unknown function DUF952  51.89 
 
 		 116 aa  94  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2107  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  93.2  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.808396  normal  0.0238058 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1067  hypothetical protein  47.66 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1917  hypothetical protein  46.88 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0606069  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0585  hypothetical protein  50.98 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0548  hypothetical protein  50.49 
 
 		 116 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303281  normal  0.0576469 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0556  hypothetical protein  49.11 
 
 		 131 aa  90.5  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0326  hypothetical protein  48.51 
 
 		 117 aa  90.5  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0221  protein of unknown function DUF952  48.04 
 
 		 117 aa  90.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.808162 
 
 
-
 
NC_004310  BR0312  hypothetical protein  48.51 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0787  hypothetical protein  46.36 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732307 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1163  hypothetical protein  47.31 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0556708  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0405  hypothetical protein  46.23 
 
 		 116 aa  85.9  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0436  hypothetical protein  47.57 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0192  protein of unknown function DUF952  44.76 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3797  protein of unknown function DUF952  45.76 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.899474 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0792  hypothetical protein  43.4 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0465  hypothetical protein  43.64 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0387  hypothetical protein  44.12 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.580664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0517  hypothetical protein  43.33 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0513  hypothetical protein  39.18 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11264  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5199  protein of unknown function DUF952  36.08 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3672  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2860  hypothetical protein  29.73 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000466115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1916  hypothetical protein  27.47 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0861  hypothetical protein  38.27 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2456  hypothetical protein  39.08 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397469 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1633  protein of unknown function DUF952  29.67 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0372909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2182  hypothetical protein  37.74 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0952783  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12720  hypothetical protein  36.11 
 
 		 129 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2228  hypothetical protein  37.74 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2171  hypothetical protein  37.74 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0419076  hitchhiker  0.00150651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3943  hypothetical protein  34.71 
 
 		 125 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_09462  conserved hypothetical protein  34.44 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2172  hypothetical protein  31.48 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>